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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001686`

染色体: Chr08 坐标: 14089223-14091422 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001686`
名称	SmilChr08G001686
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 2B
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14089223 - 14091422 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001230`
GeneID	`131001230`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001230`
原始查询	`LOC131001230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 2B
产物	actin-related protein 2/3 complex subunit 2B
Arabidopsis	`AT2G33385` (arpc2b) actin-related protein C2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817902] identity=51.1; qcov=0.989; evalue=5.33e-138; confidence=high
Rice	`Os04g0512300` - identity=45.2; qcov=0.952; evalue=4.14e-105; confidence=high
GO	GO:0005200 (structural constituent of cytoskeleton); GO:0005885 (Arp2/3 protein complex); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0030041 (actin filament polymerization); GO:0034314 (Arp2/3 complex-mediated actin nucleation); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil05100 (Bacterial invasion of epithelial cells - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04045 (P34-Arc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001230

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057783537.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783537.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783537.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783537.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14089627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:14089666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:14090199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B80
`Chr8:14090351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C44,C53
`Chr8:14091194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:14091269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:14091310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:14091313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C44,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783537.1

372 aa

186

372

P34-Arc

PF04045 P34-Arc 76-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783537.1`	Pfam	`PF04045`	P34-Arc	Family	76	291	2e-29	103.8	Arp2/3 complex, 34 kD subunit p34-Arc

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927554.1
TTGGATTCTACTCAACAACAATTTTCCCTTCTCACCAACAAATAAGGTGCCATTTTCCCTCACTCAAACAACAAGAAGAAATGGCATGCTTTGAGAGGGCATCACCAGCATTGAAGGAAATCCTTCTCAGGATACACAGAGCAGAAAAACCTCTCGAGGTAGACCACCACGTGCACGAATTTGGCTCCATACACTACCACATTAAGCATTCAGTGTCAGATCCAGTTTACACCTATTTATCAGTGTCAACACCTCTTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001230
ATGGCATGCTTTGAGAGGGCATCACCAGCATTGAAGGAAATCCTTCTCAGGATACACAGAGCAGAAAAACCTCTCGAGGTAGACCACCACGTGCACGAATTTGGCTCCATACACTACCACATTAAGCATTCAGTGTCAGATCCAGTTTACACCTATTTATCAGTGTCAACACCTCTTCTATCTCAAGGCCTCCCAATCTCATCACAGCTTCCTCATCACACGCTCCAGATGGTTAATGGGATTTTCCCCGAGGTTATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783537.1
MACFERASPALKEILLRIHRAEKPLEVDHHVHEFGSIHYHIKHSVSDPVYTYLSVSTPLLSQGLPISSQLPHHTLQMVNGIFPEVMEALVPPNEGYQLTLKLNISRIPRDKASTKMISDIASVQAVLVSSQLKEILRNVNSQEDIAHAIYKPIKLIYHPREPFFVIKQATKMSAVFPMRFKEKEDVIIATAFFQELMDVGSSEAFGKAPHCIWSPIPPAELRGEPIEDLSTNGGFLSFDITSRHVQGKKLDKTVWNLLNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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