当前解析结果
SmilChr08G001691| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001691 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001691 |
| 描述 | peroxygenase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 14152883 - 14155621 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001236 |
|---|---|
| GeneID | 131001236 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001236 |
| 原始查询 | LOC131001236 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peroxygenase-like |
| 产物 | peroxygenase-like |
| Arabidopsis | AT2G33380 (RD20)Caleosin-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817901] identity=61.6; qcov=0.958; evalue=3.67e-108; confidence=high |
| Rice | Os04g0511200 (EFA27)- identity=66.2; qcov=0.967; evalue=6.31e-117; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005509 (calcium ion binding) |
| KEGG | smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF05042 (Caleosin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001236 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057783545.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057783545.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783545.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783545.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783545.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:14153959 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C85 |
Chr8:14153959 |
C |
CG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr8:14154439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783545.1PF05042
Caleosin 60-226 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783545.1 |
Pfam | PF05042 |
Caleosin | Family | 60 | 226 | 1.5e-76 | 256.7 | Caleosin related protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。