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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001706`

染色体: Chr08 坐标: 14275141-14276903 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001706`
名称	SmilChr08G001706
描述	uncharacterized SmilChr08G001706
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14275141 - 14276903 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001250`
GeneID	`131001250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001250`
原始查询	`LOC131001250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817895]; symbol=AT2G33320; hit=AT2G33320; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817895]; symbol=AT2G33320; hit=AT2G33320; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G33320` (AT2G33320) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817895] identity=46.3; qcov=0.605; evalue=1.63e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0815100` - identity=38.9; qcov=0.392; evalue=3.43e-25; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783569.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783569.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783569.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783569.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14275495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:14275497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:14276039`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A21,A6,A7,B100,B104,B114,B122,B23,B52,B81,B98,B99,C18,C37,C43,C45,C46,C64,C66,C8,D4,D7
`Chr8:14276155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,B99,C43,C45
`Chr8:14276326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:14276396`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	119	A11,A15,A16,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B101,B104,B106,B107,B110,B111,B112,B114,B115,B119,B12,B120,B121,B123,B130,B131,B134,B136,B137,B138,B16,B19,B20,B24,B26,B3,B31,B32,B35,B36,B41,B45,B46,B47,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B7,B70,B72,B74,B75,B77,B8,B80,B83,B86,B9,B91,B94,C1,C10,C11,C15,C16,C2,C20,C22,C30,C33,C35,C38,C4,C42,C45,C47,C5,C50,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C69,C7,C70,C72,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C86,D10,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr8:14276399`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	119	A11,A15,A16,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B101,B104,B106,B107,B110,B111,B112,B114,B115,B119,B12,B120,B121,B123,B130,B131,B134,B136,B137,B138,B16,B19,B20,B24,B26,B3,B31,B32,B35,B36,B41,B45,B46,B47,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B7,B70,B72,B74,B75,B77,B8,B80,B83,B86,B9,B91,B94,C1,C10,C11,C15,C16,C2,C20,C22,C30,C33,C35,C38,C4,C42,C45,C47,C5,C50,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C69,C7,C70,C72,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C86,D10,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr8:14276466`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A15,B12,B25,B4,C36,C38,C55
`Chr8:14276504`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:14276504`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14276602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783569.1

446 aa

223

446

PF00168 C2 34-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783569.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	34	125	8.9e-13	49.1	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927586.1
AAGTGCATACACCAATTCAATCTTACAGAATCTCTTTAGTTTTGATTATATGTTATATATACATAAGCAACATTAGTAAAATTATTTAATACTATAAACATAGAGAATTGAACGTAGGGACGGTGAAATAGTGAATTAACTGGGAGCACTAAAAATCCCGTAATTCCCCCTTATTTCATGTGGTCCATTCCCATTACAAAGCCTGAGGTTCAATTCCTTGTGCTTTGTTTCCCGCCGCGGAACAACATGGCGGCAGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001250
ATGTGGTCCATTCCCATTACAAAGCCTGAGGTTCAATTCCTTGTGCTTTGTTTCCCGCCGCGGAACAACATGGCGGCAGCGGCGTTGAAAGCGTACCAGCTGCTGGAGGTGAACCTCATCTCGGCGCAGGATCTGGAGCCGCTCACCAAGAAGATGCGGACCTACTGCAAATCATGGGTCCATCCCAACAGGAAGCTCACGTCTTGCGTCGACACGGACGGCGCCCACAACCCCACGTGGAACGACAAGTTCGTTTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783569.1
MWSIPITKPEVQFLVLCFPPRNNMAAAALKAYQLLEVNLISAQDLEPLTKKMRTYCKSWVHPNRKLTSCVDTDGAHNPTWNDKFVFRVNDDFLRHDSSAVMIEIYTNHWFKDALVGTVRLLVGNLFPAPNVGMRFIALQVRRPSGRPQGILNIGVALLDGCLRSMPMYKGCSSAVGYRDLMLDLPTNLEQGNNDAGPMLLRSRSERSIYSSMVAGKPLAKSSSILSISEPMESFTITTKGKGKASSAINAAELIEKPNKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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