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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001711`

染色体: Chr08 坐标: 14319883-14326683 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001711`
名称	SmilChr08G001711
描述	uncharacterized SmilChr08G001711
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14319883 - 14326683 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001255`
GeneID	`131001255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001255`
原始查询	`LOC131001255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839272]; symbol=AT1G04140; hit=AT1G04140; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839272]; symbol=AT1G04140; hit=AT1G04140; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G04140` (AT1G04140) Transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839272] identity=51.4; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0296900` (OsWD40-169) - identity=50.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006914 (autophagy); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783576.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783576.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783576.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057783576.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14321281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C23,C69
`Chr8:14321311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C23,C69
`Chr8:14322559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C43,C45
`Chr8:14322809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B140
`Chr8:14322951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr8:14322959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B24,B46
`Chr8:14323032`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B35,C28,C41,C49,C6
`Chr8:14323032`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B35,C28,C41,C49,C6
`Chr8:14323043`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B125,C87
`Chr8:14323043`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr8:14323051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B58,B62,C72,D9
`Chr8:14323055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783576.1

773 aa

386

773

WD40

PF00400 WD40 118-140 aa PF00400 WD40 145-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783576.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	118	140	7.5e-15	55.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057783576.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	145	184	7.5e-15	55.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927593.1
CAATCACAAAAAAATTAGTAGGTTTCCAAAATTCCAAAGGAGGCATTGTCTCACGCGACAAAATATTCGCGTGGGCCGATGCTATCAGAACCCCTAGCGGGGGTATTTCCGTCATTTCATTCCCCTCTTTACATCAAATATTTCATTTCATAGCCCCGTTTGCCGGAAAATCTCGCTCCGCCTCCGCGCTCGGCTCTCCGCCTCCACCAACAAAATTTCCCTCTCCATTTTGCCCCTGCCTCTGAGATCTCCCTCCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001255
ATGAGGTCGTCTTCCATCTGGCCGGATGATTCCGCCTCTGCCGCGTCTTCGTCGTCCAGTTTCCAGCAGCTGGTGCCTCCGCCTATCGCTACGGGCACTCCCGAAAAATCTCGTCCGAGGCAAAGTAATGTATTCCAATTGTTAGCTCGGAGAGAGGTATCTCCTCAAACAAAGCGTTCAACCAGAAGATTTTGGGGCCAGGATTCCAGTCACTGTGCTGACACCTCAAGAATTAGATGTGAATCAGTCAAAGACGCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783576.1
MRSSSIWPDDSASAASSSSSFQQLVPPPIATGTPEKSRPRQSNVFQLLARREVSPQTKRSTRRFWGQDSSHCADTSRIRCESVKDARQELRSWAESGSLLHISAKYCPLQPPPRSTIAAAFSPDGKTLASTHGDHTVKIINCQTGKCLKVLSGHRRTPWVVRFHPLYPDILASGSLDHEVRLWDAKTAECIGSRDFYRPIASIAFHAQGEILAVASGHKLYMWHYNKGGEASSPTIILKTRRSLRAVHFHPHAAPFLLTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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