当前解析结果
SmilChr01G004312| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004312 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004312 |
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 61292347 - 61295172 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001256 |
|---|---|
| GeneID | 131001256 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001256 |
| 原始查询 | LOC131001256 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 产物 | protein POLYCHOME-like |
| Arabidopsis | AT2G42260 (UVI4)uv-b-insensitive 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818827] identity=46.1; qcov=1.03; evalue=1.52e-57; confidence=high |
| Rice | Os04g0472700- identity=33.8; qcov=0.597; evalue=1.3e-10; confidence=low |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0051783 (regulation of nuclear division); GO:1904667 (negative regulation of ubiquitin protein ligase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001256 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783580.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057783580.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057783580.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057783580.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783580.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:61292834 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr1:61292953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B27,C47 |
Chr1:61292962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,C2,C32,C68 |
Chr1:61292977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr1:61293094 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C2,C32,C68 |
Chr1:61293143 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr1:61294415 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A11 |
Chr1:61294415 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A11 |
Chr1:61294477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B27,C47 |
Chr1:61294505 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。