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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001714`

染色体: Chr08 坐标: 14370145-14372354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001714`
名称	SmilChr08G001714
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14370145 - 14372354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001259`
GeneID	`131001259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001259`
原始查询	`LOC131001259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA3
产物	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA3
Arabidopsis	`AT1G04610` (YUC3) YUCCA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839474] identity=72.6; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0128900` (YUCCA7) - identity=64.3; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004499 (N,N-dimethylaniline monooxygenase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding); GO:0050661 (NADP binding)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00743 (FMO-like); PF07992 (Pyr_redox_2); PF13434 (Lys_Orn_oxgnase); PF13450 (NAD_binding_8); PF13738 (Pyr_redox_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783579.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057783579.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057783579.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783579.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14370434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:14370559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B46,C46
`Chr8:14370616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C82,D8
`Chr8:14371113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B134
`Chr8:14371210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:14371281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:14371891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783579.1

404 aa

202

404

Pyr_redox_2

Pyr_redox_3

NAD_binding_8

FMO-like

Lys_Orn_oxgnase

PF07992 Pyr_redox_2 20-203 aa PF13738 Pyr_redox_3 20-213 aa PF13450 NAD_binding_8 21-62 aa PF00743 FMO-like 21-333 aa PF13434 Lys_Orn_oxgnase 85-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783579.1`	Pfam	`PF07992`	Pyr_redox_2	Domain	20	203	2.9e-12	47.4	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057783579.1`	Pfam	`PF13738`	Pyr_redox_3	Family	20	213	2.4e-23	83.6	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057783579.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	21	62	2.4e-05	25.3	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057783579.1`	Pfam	`PF00743`	FMO-like	Family	21	333	3.6e-25	89.1	Flavin-binding monooxygenase-like
`XP_057783579.1`	Pfam	`PF13434`	Lys_Orn_oxgnase	Family	85	203	1.2e-12	48.4	L-lysine 6-monooxygenase/L-ornithine 5-monooxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927596.1
TCCAACTCCACTCTCTCAAATGAACAGCCAGTGCGACGACTTCTTCTCGGGGCGATGCGTACTTGTAAACGGCCCCGTGATCGTGGGCGCGGGCCCCTCCGGCCTGGCGGTGGCGGCGGGCCTCAAACAAGAGGGCGTGCCCTTGGTGATCCTGGAACGAGCCAGCTGCATTGCGTCGCTGTGGCAGAACCGAACCTACGACCGCCTCAAGCTCCACCTGCCCAAGCAATTCTGCGAGCTCCCCTACGCCCCCTTCCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001259
ATGAACAGCCAGTGCGACGACTTCTTCTCGGGGCGATGCGTACTTGTAAACGGCCCCGTGATCGTGGGCGCGGGCCCCTCCGGCCTGGCGGTGGCGGCGGGCCTCAAACAAGAGGGCGTGCCCTTGGTGATCCTGGAACGAGCCAGCTGCATTGCGTCGCTGTGGCAGAACCGAACCTACGACCGCCTCAAGCTCCACCTGCCCAAGCAATTCTGCGAGCTCCCCTACGCCCCCTTCCCGCCCGACTTCCCGCAATACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783579.1
MNSQCDDFFSGRCVLVNGPVIVGAGPSGLAVAAGLKQEGVPLVILERASCIASLWQNRTYDRLKLHLPKQFCELPYAPFPPDFPQYPSKRHFIDYLHSYAARFQIVPRFNESVLSANYDQTCGLWRVKTVSGAAEYICRWLVVATGENAEKVVPEFQGLHDFGGAVMHACDYKSGEFYRGKKVLVVGCGNSGMEVSLDLCHHHAFPSMVVRSSVHVLPREILGKSTFELGVSLMKWMPIWVVDKILLAAARLILGNIEKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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