当前解析结果
SmilChr08G001724| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001724 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001724 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001724 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 14485522 - 14486225 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001268 |
|---|---|
| GeneID | 131001268 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001268 |
| 原始查询 | LOC131001268 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001268 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057783594.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783594.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783594.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783594.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783594.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:14485800 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,B3 |
Chr8:14485832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B3 |
Chr8:14485853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr8:14485873 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A1,B106,B12,B130,B31,B91,C42 |
Chr8:14485884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr8:14485938 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr8:14485970 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B4,B54,B67,B7,C33 |
Chr8:14486000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr8:14486042 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr8:14486043 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 70 | A11,A13,A14,A19,A21,A22,A25,A3,A8,B102,B103,B105,B108,B11,B113,B114,B136,B15,B17,B2,B21,B22,B28,B32,B36,B44,B46,B49,B55,B57,B59,B60,B61,B69,B71,B72,B74,B80,B90,B92,B96,B97,C1,C14,C15,C17,C18,C23,C24,C26,C28,C29,C32,C35,C44,C46,C5,C54,C56,C62,C65,C70,C71,C73,C78,C80,C84,C85,D10,D6 |
Chr8:14486047 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 70 | A11,A13,A14,A19,A21,A22,A25,A3,A8,B102,B103,B105,B108,B11,B113,B114,B136,B15,B17,B2,B21,B22,B28,B32,B36,B44,B46,B49,B55,B57,B59,B60,B61,B69,B71,B72,B74,B80,B90,B92,B96,B97,C1,C14,C15,C17,C18,C23,C24,C26,C28,C29,C32,C35,C44,C46,C5,C54,C56,C62,C65,C70,C71,C73,C78,C80,C84,C85,D10,D6 |
Chr8:14486105 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。