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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001728`

染色体: Chr08 坐标: 14535789-14538336 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001728`
名称	SmilChr08G001728
描述	purple acid phosphatase 23
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14535789 - 14538336 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001273`
GeneID	`131001273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001273`
原始查询	`LOC131001273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 23
产物	purple acid phosphatase 23
Arabidopsis	`AT4G13700` (PAP23) purple acid phosphatase 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827004] identity=74.2; qcov=0.759; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0280100` (OsPAP23) - identity=67.3; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF14008 (Metallophos_C); PF16656 (Pur_ac_phosph_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783599.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057783599.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783599.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783599.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14536010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:14536088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:14536991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C52
`Chr8:14537146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:14537196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:14537327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,C32,C35,C65,C68
`Chr8:14537361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B82,C20,C48
`Chr8:14537378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:14537696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C52
`Chr8:14537703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B82,C20,C39,C48
`Chr8:14537946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:14538207`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A7,B23,B81,B87,C18,C44,C46,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783599.1

586 aa

293

586

Pur_ac_phosph_N

Metallophos

Metallophos_C

PF16656 Pur_ac_phosph_N 67-178 aa PF00149 Metallophos 190-403 aa PF14008 Metallophos_C 471-509 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783599.1`	Pfam	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	Domain	67	178	7.5e-16	59.2	Purple acid Phosphatase, N-terminal domain
`XP_057783599.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	190	403	8.2e-18	66.3	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057783599.1`	Pfam	`PF14008`	Metallophos_C	Domain	471	509	3.4e-16	60.3	Iron/zinc purple acid phosphatase-like protein C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927616.1
AGAATATTCCAAGAATAAAATAAGTTGATCATCACTGATCCATCATTCAACATACAAAGCAAAAAACAGTGGTCGTTAAAGTGTAACTGTGAAAGTGAAACTCTTGCAATCCATGTTTATCACAAATTTACTCAATCTTTATCAACACAACTGTATCACCATCAAGAAGAAACAAACTTAAGAAATGGATAACCTCCTGTTCTTAGCTCTGATGATCACGACCACAAACAAGGTGTTTGCAGCTTCATCTCACCACATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001273
ATGGATAACCTCCTGTTCTTAGCTCTGATGATCACGACCACAAACAAGGTGTTTGCAGCTTCATCTCACCACATTCCGACCACCCTAGAAGGCCCTTTTGCGCCGGTAACTCGCCGTTTCGACGCGTCGTTGCGCCGCGGCAGCGATGACTTGCCTATGGATCATCCTCGCCTGAGGAAGAATGTCACCTCTAATTTTCCTGAGCAGATTGCTCTTGCATTGTCCACTCCATCCTCACTCTGGGTTTCTTGGCTCACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783599.1
MDNLLFLALMITTTNKVFAASSHHIPTTLEGPFAPVTRRFDASLRRGSDDLPMDHPRLRKNVTSNFPEQIALALSTPSSLWVSWLTGDAQIGLNVTPLDPTTVASEVWYGKESGKYTAKKSGISLIYSQLYQFEGLLNYTSGIIHHVKIDGLEAKTKYYYKCGDSSIDAMSEEHVFETLPSPSSESYPCKIAVVGDLGLTSNSTTTIDHLITNDPCLVLMVGDLTYANQYLTTGGKGASCYSCAFPDSPIRETYQPRWDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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