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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001747`

染色体: Chr08 坐标: 14691906-14693801 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001747`
名称	SmilChr08G001747
描述	F-box protein At2g02240-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14691906 - 14693801 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001291`
GeneID	`131001291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001291`
原始查询	`LOC131001291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At2g02240-like
产物	F-box protein At2g02240-like
Arabidopsis	`AT1G80110` (PP2-B11) phloem protein 2-B11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844351] identity=39.9; qcov=1.01; evalue=8.82e-55; confidence=medium
Rice	`Os12g0131400` (OsFbox640) - identity=35; qcov=1.06; evalue=7.93e-49; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783627.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783627.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783627.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783627.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14692154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,C8
`Chr8:14692162`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:14692162`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr8:14692224`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C63,C67
`Chr8:14692224`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr8:14692290`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B82,C48
`Chr8:14692290`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B82,C48
`Chr8:14692329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,C8
`Chr8:14693068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14693107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:14693411`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A19,B132,B134,B30,B55,B91,C44,C83,D10
`Chr8:14693506`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A20,A25,A5,B127,B38,B39,B74,B75,B80,C2,C65,C72,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783627.1

255 aa

128

255

F-box

PP2

PF00646 F-box 6-45 aa PF14299 PP2 98-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783627.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	45	8.2e-05	23.1	F-box domain
`XP_057783627.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	98	254	2.7e-35	122.3	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927644.1
TTGAGATGTTGGTACATGGCACGATCAAAATTTCCGTGCCGCCTAGTAAAATTAGGTAAGAAAGCGACTTGGAAATTTCAGACCAAACCAAACCAAACAATTACGCGTGTGTGATAATTTTCTTTCAATTTTAGCAAGAAAAATGTGAAGGCCGTTTTTAGTTCTGCTCCTATATAAAACCAAACACACATATATAGTTGATCACCATTTAGAGAGAGTTTAGGTAGTATGGATTGGTTTGCAAAATTGCCCGAGGGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001291
ATGGATTGGTTTGCAAAATTGCCCGAGGGCTGCATATCAGAGATTCTGTCACACACTTCAGCTTTGGATGCTTCGAGATCATCGGTTGTGTCGAAAGAGCTCAATTCTGTAGCACAAAACGACCTCGTTTGGGACAGATTCTTGCCGCTTGATTACCAAGATATCATCTCCAAAGCAGTTTCTCCTCTCAAATACGCCACCAAGAAAGACCTCTATTTCACCCTCTCCCACTTCCCTATCCTCATTCATCAACCCAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783627.1
MDWFAKLPEGCISEILSHTSALDASRSSVVSKELNSVAQNDLVWDRFLPLDYQDIISKAVSPLKYATKKDLYFTLSHFPILIHQPKMSFSIDKTSGRKCFMVGARELMISWKGCWDFMPNPMSRFSEVAKLRSIGWIHIQGKIKTEILSKNTSYAAYLVFWLESKEGLRSSNTVIRLIQNDKSKSNGSKKERIESRETGKIGNMRGDGWLEIEMGRFYNGNGDDDGGEVEAWLTEINSPYDKSGFIVEGIEFRPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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