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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001758`

染色体: Chr08 坐标: 14780060-14781930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001758`
名称	SmilChr08G001758
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14780060 - 14781930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001301`
GeneID	`131001301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001301`
原始查询	`LOC131001301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
Arabidopsis	`AT3G22104` (AT3G22104) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821773] identity=35.6; qcov=0.986; evalue=3.02e-91; confidence=medium
Rice	`Os07g0546400` - identity=36; qcov=0.891; evalue=2.07e-72; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783638.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783638.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783638.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783638.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14780183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D4
`Chr8:14780571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B82,C48
`Chr8:14780746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B53,C82
`Chr8:14780752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B40
`Chr8:14780868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:14780946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C80
`Chr8:14780964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B40
`Chr8:14781060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C37
`Chr8:14781085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:14781161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:14781199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:14781622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783638.1

487 aa

244

487

BTB

NPH3

PF00651 BTB 2-92 aa PF03000 NPH3 179-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783638.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	2	92	1.8e-07	32.0	BTB/POZ domain
`XP_057783638.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	179	402	1.6e-45	156.5	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927655.1
TACTCTCATTAACCAACTCCTATATTCTCTTCTCATTCAACTTATTCTTGATTCAAACTTCCACCATCTTAGCTCCAAAAATAATCACACACCAAATATTTCCTTACGTTTTAGTCGATTTTCTTGTTCATCATATATAACTCAAAAATGTTGTCTGATCTTCAAGTAGATGTCAATGGCCAAGAGTCTTTCTCTGTCAGCAAGAAAATTCTTGCATCTCTCTCTGGTAAATTAAGGAAGATGTTCGGTAAGTCAGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001301
ATGTTGTCTGATCTTCAAGTAGATGTCAATGGCCAAGAGTCTTTCTCTGTCAGCAAGAAAATTCTTGCATCTCTCTCTGGTAAATTAAGGAAGATGTTCGGTAAGTCAGCAACAAACATAACAGAAAGCCTCAAACTGATTTTTCAAGACTTTCCCGGTGGCGCCGAAGGATTTGAACTGATTGTTAGATTCTGTTACAACGGAGGCAGAATCGACATAACCCCGTGTAACGTGGTGCTACTGCACTCTGCTGCTAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783638.1
MLSDLQVDVNGQESFSVSKKILASLSGKLRKMFGKSATNITESLKLIFQDFPGGAEGFELIVRFCYNGGRIDITPCNVVLLHSAARYLEIKEDQTTKYFQIVHFWTWSELLHCLRQCQEFSSLVKSSTIVEEILNAVVEKISMSRSPFDFSCSDYSGDVSTNSSSRSSSFLHTANLLGDLEFLNTEFFDKVLSTMISEKLDHGVVCSLLVHYQKVRFVGLLAADERCRIVEVVITCLSSLNGGFRVFPFRNLCDILRACL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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