当前解析结果
SmilChr08G001766| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001766 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001766 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001766 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 14875601 - 14878512 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001308 |
|---|---|
| GeneID | 131001308 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001308 |
| 原始查询 | LOC131001308 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os07g0657600; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os07g0657600; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os07g0657600- identity=47.6; qcov=1.01; evalue=3.06e-131; confidence=high |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006285 (base-excision repair, AP site formation); GO:0034039 (8-oxo-7,8-dihydroguanine DNA N-glycosylase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001308 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783649.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057783649.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783649.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783649.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783649.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:14875841 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr8:14875847 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,C41 |
Chr8:14876024 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr8:14876259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr8:14876269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr8:14876286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr8:14876384 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D6 |
Chr8:14876384 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:14876480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:14876578 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr8:14876611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C40 |
Chr8:14876631 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。