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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001769`

染色体: Chr08 坐标: 14898361-14904617 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001769`
名称	SmilChr08G001769
描述	vacuolar protein sorting 38
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14898361 - 14904617 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001312`
GeneID	`131001312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001312`
原始查询	`LOC131001312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting 38
产物	vacuolar protein sorting 38
Arabidopsis	`AT2G32760` (AT2G32760) UV radiation resistance-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817836] identity=60.3; qcov=1; evalue=4.56e-116; confidence=high
Rice	`Os06g0715000` - identity=47.2; qcov=1.03; evalue=1.1e-81; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0000323 (lytic vacuole); GO:0005768 (endosome); GO:0035493 (SNARE complex assembly)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10186 (ATG14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783655.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057783656.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057783656.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057783655.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057783655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14898784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B100,B138,C14,C4
`Chr8:14901422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:14903655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783655.1

356 aa

178

356

ATG14

PF10186 ATG14 15-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783655.1`	Pfam	`PF10186`	ATG14	Family	15	302	4.2e-09	36.7	Vacuolar sorting 38 and autophagy-related subunit 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927672.1
ATAAGAGCGTTACTTTTAAGCATCACACGCTTTACGACCTCCCAGCCAGCTGCGTCACTGAAAGAAAAAAAAAAACCAAATTGAGGAAAATAAAACGGGGGAAAATCGAACAAAAATAACTGTTGCACTTTCCTTTCTTCGATTTCTTCCAATTTCCCCAAAATTCAAAGATTTATAGCTATGAGGTCACGGTTCTCGCCATCTAAACCCTAGATTTTCTCCTGAAAGTTATTCGTAGTACGATGGTGAAGAGGAGCTAC...

XM_057927673.1
CAGGAGGATCAGCCTGCGAAGGTCATAGAATGGGAGGATTACGAGCAGGAGCTCGCTCGTTTGTGCAGTTTGACCTCCGCACTTGAGGAAGCCAAGAGTAAGAAATTGGTGCTTGAAGAGAAGCTTCAGTCGTCGATACAAAATCTGAGTCATTAAGTCGGTCAAATGAGCTTGATCAGATGCGTGAGAAATTGGAACATCGTAAGTTGTTGATGGGGAAGATGTCTATGCATTCAAAGGTTGTAAAAGAGAAGGTAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001312
ATGGGGTCGTCTAAAAAGCCAATTGTGAAGGTACAAGAGGAAAAGCGGGTAGCACAGGAGGATCAGCCTGCGAAGGTCATAGAATGGGAGGATTACGAGCAGGAGCTCGCTCGTTTGTGCAGTTTGACCTCCGCACTTGAGGAAGCCAAGAGTAAGAAATTGGTGCTTGAAGAGAAGCTTCAGTCGTCGATACAAATAGAATCTGAGTCATTAAGTCGGTCAAATGAGCTTGATCAGATGCGTGAGAAATTGGAACATCG...

LOC131001312
ATGCGTGAGAAATTGGAACATCGTAAGTTGTTGATGGGGAAGATGTCTATGCATTCAAAGGTTGTAAAAGAGAAGGTAAGAAAGCAGGAGGAACAACTTAGTGGTGAAATTAGATCTCTTTTGGTCGGTGGAAGTTCTCTTTCTGTGGCCAACAAACGCATGCAGGACTCAAGTAGGTCACTTGCTGGAGAAAAAGGTTATGGTCACTTGAAAAATTTGCAAAAATCAAAGAGATTGAGGCAACAGTATATGGTCTCCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783655.1
MGSSKKPIVKVQEEKRVAQEDQPAKVIEWEDYEQELARLCSLTSALEEAKSKKLVLEEKLQSSIQIESESLSRSNELDQMREKLEHRKLLMGKMSMHSKVVKEKVRKQEEQLSGEIRSLLVGGSSLSVANKRMQDSSRSLAGEKGYGHLKNLQKSKRLRQQYMVSQVTLLYPVKLVVRKASEQELESFRSIKTGVPDGSKPLDQGTLTISGLHLTVSFTKMSFFTDKKEVQRSSTALGYVAHAVSLIASYLQVPLRYPLR...

XP_057783656.1
MREKLEHRKLLMGKMSMHSKVVKEKVRKQEEQLSGEIRSLLVGGSSLSVANKRMQDSSRSLAGEKGYGHLKNLQKSKRLRQQYMVSQVTLLYPVKLVVRKASEQELESFRSIKTGVPDGSKPLDQGTLTISGLHLTVSFTKMSFFTDKKEVQRSSTALGYVAHAVSLIASYLQVPLRYPLRLGGSRSYIRDYSPSVEHSASSTSLDTIISTSSKPVEFPLFIEGQDSTRAAYAVFLLNKDLEQLLNFIGVKSLGPRHILA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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