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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001773`

染色体: Chr08 坐标: 14957807-14963167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001773`
名称	SmilChr08G001773
描述	probable methionine--tRNA ligase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14957807 - 14963167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001318`
GeneID	`131001318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001318`
原始查询	`LOC131001318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methionine--tRNA ligase
产物	probable methionine--tRNA ligase
Arabidopsis	`AT4G13780` (AT4G13780) methionine-tRNA ligase, putative / methionyl-tRNA synthetase, putative / MetRS [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827012] identity=76.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0400100` - identity=76.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004825 (methionine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006431 (methionyl-tRNA aminoacylation); GO:0017101 (aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex)
KEGG	smil00450 (Selenocompound metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00133 (tRNA-synt_1); PF09334 (tRNA-synt_1g); PF19303 (Anticodon_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783662.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783662.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783662.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783662.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14958239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B53,B72,C82
`Chr8:14958252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:14959600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:14959629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:14960167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B41,B51
`Chr8:14960273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:14960587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B41,B51
`Chr8:14961387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:14962559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783662.1

607 aa

304

607

tRNA-synt_1

tRNA-synt_1g

Anticodon_3

PF00133 tRNA-synt_1 16-261 aa PF09334 tRNA-synt_1g 18-412 aa PF19303 Anticodon_3 437-588 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783662.1`	Pfam	`PF00133`	tRNA-synt_1	Domain	16	261	3.9e-11	43.1	tRNA synthetases class I (I, L, M and V)
`XP_057783662.1`	Pfam	`PF09334`	tRNA-synt_1g	Family	18	412	2e-155	518.1	tRNA synthetases class I (M)
`XP_057783662.1`	Pfam	`PF19303`	Anticodon_3	Domain	437	588	1.3e-18	68.0	Anticodon binding domain of methionyl tRNA ligase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927679.1
CAAAGTTGAAGAATTGGTTAGAATGCAAGTGTCTCCAAATTGTTAAGTCAACGTATATGCTAAGAAACTTCCAAACCCAAAAATCTCCATATTGATATAGCAGTCAAGCCTACTTGTGGCAGCAGAATCCAAGCTACATCCCATACTACGTATATTTCGCAAAAGTGAGAAAATAGTCGAAAAATGGGCGATGAGAGCGCAGGCGCGAAGCTGCCGATACAAGGGAAGCGGAACATCCTCATCACGAGCGCCTTGCCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001318
ATGGGCGATGAGAGCGCAGGCGCGAAGCTGCCGATACAAGGGAAGCGGAACATCCTCATCACGAGCGCCTTGCCTTACGTAAACAACGTCCCGCACCTCGGCAACATCATCGGATCTGTTCTGAGCGGCGATGTGTTTGCACGATATTGCCGGATGAGGGGTTATAACGTCATCTATATCTGTGGTACGGATGAGTACGGCACCGCAACAGAGACTAAGGCAATGGAGGAGGGCTCTTCTCCCAAACAGATCTGTGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783662.1
MGDESAGAKLPIQGKRNILITSALPYVNNVPHLGNIIGSVLSGDVFARYCRMRGYNVIYICGTDEYGTATETKAMEEGSSPKQICDKYHAIHKEVYKWFGISFDEFGRTSSAQQTEVCQDIFKKLLENNWLSENIMQQLYCETCKRFLADRLVEGSCPTPGCNYDSARGDQCEKCGKLLNPTELLEPKCKVCRSTPHIRDTNHMFLELPLLKEKLEEYINSTSVMGGWSQNAIQATHAWLREGLKPRCITRDLKWGVPVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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