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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001788`

染色体: Chr08 坐标: 15067187-15070674 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001788`
名称	SmilChr08G001788
描述	probable mitochondrial adenine nucleotide transporter BTL3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15067187 - 15070674 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001331`
GeneID	`131001331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001331`
原始查询	`LOC131001331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable mitochondrial adenine nucleotide transporter BTL3
产物	probable mitochondrial adenine nucleotide transporter BTL3
Arabidopsis	`AT5G64970` (AT5G64970) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836621] identity=77.7; qcov=0.742; evalue=1.24e-172; confidence=high
Rice	`Os03g0191100` - identity=65.6; qcov=0.976; evalue=1.68e-173; confidence=high
GO	GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057783679.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057783679.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057783679.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783679.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15069675`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B24,B99,C87
`Chr8:15069675`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B24,B99,C87
`Chr8:15069736`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A23,B103,B126,B136,B23,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783679.1

452 aa

226

452

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 115-201 aa PF00153 Mito_carr 209-295 aa PF00153 Mito_carr 322-404 aa

XP_057783680.1

411 aa

206

411

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 115-201 aa PF00153 Mito_carr 209-295 aa PF00153 Mito_carr 322-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783679.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	115	201	6.6e-59	196.4	Mitochondrial carrier protein
`XP_057783679.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	209	295	6.6e-59	196.4	Mitochondrial carrier protein
`XP_057783679.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	322	404	6.6e-59	196.4	Mitochondrial carrier protein
`XP_057783680.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	115	201	7e-65	215.5	Mitochondrial carrier protein
`XP_057783680.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	209	295	7e-65	215.5	Mitochondrial carrier protein
`XP_057783680.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	322	408	7e-65	215.5	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927697.1
GGGTAAACGATGGAGTAATAACCAAGAGAGCCTCAGAAAAGTACATCATTAGTTAGGAAAAATAAGTGGTTTGCAACATTGTGATACTGATGCAGGCTGAGAGCTCTGCTAGCCATGGAACCCCCGCTCACAAGCTGCTGTTTTATACCGTTGGATGATTATTCACTAACATTTCCATTTTCAAGCATTAACATCCCAATCCCAAATGCCTGACATCATTCATCACTCCCCAAGTTTATACGATTTCAAATCACAAAATG...

XM_057927696.1
AGAGAGCCTCAGAAAAGTACATCATTAGTTAGGAAAAATAAGTGGTTTGCAACATTGTGATACTGATGCAGGCTGAGAGCTCTGCTAGCCATGGAACCCCCGCTCACAAGCTGCTGTTTTATACCGTTGGATGATTATTCACTAACATTTCCATTTTCAAGCATTAACATCCCAATCCCAAATGCCTGACATCATTCATCACTCCCCAAGTTTATACGATTTCAAATCACAAAATGTCTGAATCCAGTATTCGGCTGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001331
ATGTCTGAATCCAGTATTCGGCTGAACGATTCTACTCAGCTCATACCCGATTACTCGAATAACCCATTTTTCTTTCCCGGTGGAATATTCCTGGATTCTAGCGCAATTCCTTCGTCAATTATCAATAAAATTGTCGGCGAAGTTTCTTGTTACAGTCGCCCCGTGCAATCTCGGAGAAAACGGGGCGAGTTTTTGTGTTTAAGTTTGTCTGTTAAAGGGAAAGATAGAGCAATTAGCAACTCGGCGGAATCTGCGGGAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783679.1
MSESSIRLNDSTQLIPDYSNNPFFFPGGIFLDSSAIPSSIINKIVGEVSCYSRPVQSRRKRGEFLCLSLSVKGKDRAISNSAESAGSSERNEAVGRAVTKPEKGVKIRLRGQGAMNTTKHLCAGAVAAMVSRTCLAPLERLKLEYIVRGEKGDLYMLIKRIATTQGLRGFWKGNFVNILRTAPFKAINFCAYDTYRKQLLKLSGNEETTNSERFIAGAAAGITATVLCLPLDTIRTRLVAPGGELLGGVIGAFRHVVQNE...

XP_057783680.1
MSESSIRLNDSTQLIPDYSNNPFFFPGGIFLDSSAIPSSIINKIVGEVSCYSRPVQSRRKRGEFLCLSLSVKGKDRAISNSAESAGSSERNEAVGRAVTKPEKGVKIRLRGQGAMNTTKHLCAGAVAAMVSRTCLAPLERLKLEYIVRGEKGDLYMLIKRIATTQGLRGFWKGNFVNILRTAPFKAINFCAYDTYRKQLLKLSGNEETTNSERFIAGAAAGITATVLCLPLDTIRTRLVAPGGELLGGVIGAFRHVVQNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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