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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004320`

染色体: Chr01 坐标: 61372572-61375018 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004320`
名称	SmilChr01G004320
描述	probable polygalacturonase At1g80170
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61372572 - 61375018 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001335`
GeneID	`131001335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001335`
原始查询	`LOC131001335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At1g80170
产物	probable polygalacturonase At1g80170
Arabidopsis	`AT3G57790` (AT3G57790) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824949] identity=69.7; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0487600` (OsPGL35) - identity=64.6; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057783686.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057783686.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057783686.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783686.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61372884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:61373003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B28
`Chr1:61373117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,D9
`Chr1:61373220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:61374630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:61374836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:61374881`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B77,C74
`Chr1:61374881`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B77,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783686.1

485 aa

242

485

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 42-99 aa PF00295 Glyco_hydro_28 107-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783686.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	42	99	1.6e-15	58.2	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057783686.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	107	395	8.3e-24	85.0	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927703.1
AAATATATTTTTTAAAATATTACTCTGTATAACAAAACAGAGCGTTGGAAATAAAACTAAAATTTTATACTTATTTTTATGTTAAAGCTCCTGTACCATAGACAATGTGCTTGAGAGATGCCCTTACAACTGAAATTATACCCTAAATTCTAGTACTAATTGTTTTTCCTCCAAAAACAAAATATCATGAATTCAATCACTTTTCTTCGCATCCAATTATATCTCATCTTAGCTGCTACTCTGTTCCAATCACTATCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001335
ATGAATTCAATCACTTTTCTTCGCATCCAATTATATCTCATCTTAGCTGCTACTCTGTTCCAATCACTATCCGCCGCGTCACGGCTCTCCAGCCTCCAACACTGCGGCGACGATCTCTCCCTCTCCGTCGCGGACTACGGCGCCACGGGCCACGGCCGCCGCTACGACACTGTTGCAATCCAATCTGCCATCGACGACTGCGCCTCCGCGGCCGCCCGCCGCTGCCGCACCTGCCAGGTCCACTTCCCGCCGGGCAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783686.1
MNSITFLRIQLYLILAATLFQSLSAASRLSSLQHCGDDLSLSVADYGATGHGRRYDTVAIQSAIDDCASAAARRCRTCQVHFPPGKYLTATLYLKSGVVLDVSRNATILGGTKLQDYPEKQDKWYVVLAENAVDVGITGGGEINGQGLEFVTRFDERKNVMVSWNRTGACLGDECRPRLVGFIGCRNVRIWNVSFNEPAYWCLHIVRCQNTSIHDTSIFGDFNTPNNDGIDIEDSNNTLITRCTINTGDDAICPKTYTSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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