当前解析结果
SmilChr08G001826| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001826 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001826 |
| 描述 | laccase-14-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 15599036 - 15601568 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001349 |
|---|---|
| GeneID | 131001349 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001349 |
| 原始查询 | LOC131001349 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | laccase-14-like |
| 产物 | laccase-14-like |
| Arabidopsis | AT5G09360 (LAC14)laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=46.4; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0749700 (OsLAC10)- identity=46.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001349 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057783701.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783701.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783701.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783701.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783701.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783701.1PF07732
Cu-oxidase_3 35-149 aa
PF00394
Cu-oxidase 162-287 aa
PF07731
Cu-oxidase_2 412-547 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783701.1 |
Pfam | PF07732 |
Cu-oxidase_3 | Domain | 35 | 149 | 2.3e-40 | 138.1 | Multicopper oxidase |
XP_057783701.1 |
Pfam | PF00394 |
Cu-oxidase | Domain | 162 | 287 | 1e-35 | 123.9 | Multicopper oxidase |
XP_057783701.1 |
Pfam | PF07731 |
Cu-oxidase_2 | Domain | 412 | 547 | 1.2e-43 | 148.8 | Multicopper oxidase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。