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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001799`

染色体: Chr08 坐标: 15171404-15173489 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001799`
名称	SmilChr08G001799
描述	pirin-like protein
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15171404 - 15173489 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001364`
GeneID	`131001364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001364`
原始查询	`LOC131001364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pirin-like protein
产物	pirin-like protein
Arabidopsis	`AT2G43120` (AT2G43120) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818914] identity=70.7; qcov=0.924; evalue=1.26e-156; confidence=high
Rice	`Os03g0845000` (OSJNBa0032G11.22) - identity=66.9; qcov=1.03; evalue=2.52e-165; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02678 (Pirin); PF05726 (Pirin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783722.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783722.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057783722.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057783722.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15171764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:15172286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr8:15172895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C71
`Chr8:15172945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:15173085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783722.1

329 aa

164

329

Pirin

Pirin_C

PF02678 Pirin 68-161 aa PF05726 Pirin_C 214-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783722.1`	Pfam	`PF02678`	Pirin	Family	68	161	2.6e-32	111.7	Pirin
`XP_057783722.1`	Pfam	`PF05726`	Pirin_C	Domain	214	318	4.7e-34	117.6	Pirin C-terminal cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927739.1
AGTGAATGTTTGTATTTTTCTATGAAAGTTGTGAAAAATGAAAATCAAAGTTGACGAGAATTAAAAAACGCAGTAAAAGAAAGTGGTTATGTGAGGCATATAAATAAGAGGTGTGGGAGCAGACAGAAGAGACAGAGGCAGCGTGTAGTGTTTTTATATGATCTCTGCAACCAAACTAGTGTTGTTGAATCTCACAAAACACAAACCCAACAACATCAATACACCAAAACGCCAAATTTATTCTCATTTTCTGAGAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001364
ATGATCTCTGCAACCAAACTAGTGTTGTTGAATCTCACAAAACACAAACCCAACAACATCAATACACCAAAACGCCAAATTTATTCTCATTTTCTGAGAAATATAATGTCTCTAACCGCTCAATCCACGGCCTTCCAACACCCCAGATTGGTAGCCAAGAAACTCTTGGCCAAGCCCCAGAGCGAGGGAGAAGGTGCAGTTGTCAGAAGAAGCATCGGAAGGCCCGAGTTCAAGTCCCTGGATCCTTTCCTCTTGCTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783722.1
MISATKLVLLNLTKHKPNNINTPKRQIYSHFLRNIMSLTAQSTAFQHPRLVAKKLLAKPQSEGEGAVVRRSIGRPEFKSLDPFLLLDEFSVSPPAGFPDHPHRGFETVTYVLQGGITHQDFAGHKGTIHAGEVQWMTAGRGIVHSEMPAGEGTHTGLQLWINLSSNDKMIEPRYQELLRDDIPNAEEDGVEVRVIAGESMGVHSPVYTRTPTMYLDFTLQHNSQHHQRIPESWNAFAYIIEGEGVFGIPNSPPVSAHHIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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