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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001856`

染色体: Chr08 坐标: 15941722-15942343 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001856`
名称	SmilChr08G001856
描述	chaperone protein dnaJ 20, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15941722 - 15942343 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001398`
GeneID	`131001398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001398`
原始查询	`LOC131001398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 20, chloroplastic-like
产物	chaperone protein dnaJ 20%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G35720` (OWL1) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818142] identity=47.22; qcov=0.531; evalue=7.18e-12; confidence=low
Rice	`Os01g0101700` (OsDjC1) - identity=49.27; qcov=0.516; evalue=1.72e-13; confidence=low
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0061077 (GO:0061077)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001398

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783764.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057783764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15941991`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B120,B140,B90,C41
`Chr8:15941991`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B120,B140,B90,C41
`Chr8:15942067`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr8:15942067`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C84
`Chr8:15942209`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B46,C24,C59,C71
`Chr8:15942209`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B46,C24,C59,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783764.1

128 aa

128

DnaJ

PF00226 DnaJ 35-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783764.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	35	97	2.3e-18	66.7	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927781.1
GCGTCCATGAGCATGAGCAAGAGCAACCACAAGTTATTACAGAAACGCAACCTAGCCTCCAAAAACCCTAGAAAGAAAGCCATAATTTCATGCATGCCGCCGAAAATGAACTTGTACCGACTTCTCTCTCTCTCATCGCCAAATGTAGGGTTCGATGAGATCAAGAGAGCCTACAGATCCATGGCTCTTCTCTACCACCCTGATGTCTGCACAAACCCTCAATCCACGCCTCGATTCATCGAGATACGCCACGCCTACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783764.1_42705
ATGAGCATGAGCAAGAGCAACCACAAGTTATTACAGAAACGCAACCTAGCCTCCAAAAACCCTAGAAAGAAAGCCATAATTTCATGCATGCCGCCGAAAATGAACTTGTACCGACTTCTCTCTCTCTCATCGCCAAATGTAGGGTTCGATGAGATCAAGAGAGCCTACAGATCCATGGCTCTTCTCTACCACCCTGATGTCTGCACAAACCCTCAATCCACGCCTCGATTCATCGAGATACGCCACGCCTACGACACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783764.1
MSMSKSNHKLLQKRNLASKNPRKKAIISCMPPKMNLYRLLSLSSPNVGFDEIKRAYRSMALLYHPDVCTNPQSTPRFIEIRHAYDTLSDPKSRQIYDLQLDGSRKLWERQLHGLRERCDQRIKTRRFM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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