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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001864`

染色体: Chr08 坐标: 16000921-16004918 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001864`
名称	SmilChr08G001864
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16000921 - 16004918 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001404`
GeneID	`131001404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001404`
原始查询	`LOC131001404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G39790` (AT4G39790) bZIP transcription factor, putative (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830137] identity=48.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0172300` - identity=45.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783773.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783773.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783773.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783773.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16001955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:16002018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:16002099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr8:16002276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B42,C22,C43
`Chr8:16003766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:16003863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B91,C21,C36
`Chr8:16004444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783773.1

712 aa

356

712

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 285-621 aa

XP_057783774.1

712 aa

356

712

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 285-621 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783773.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	2.1e-26	92.6	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057783773.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	285	621	2.2e-114	382.8	Protein of unknown function (DUF632)
`XP_057783774.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	2.1e-26	92.6	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057783774.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	285	621	2.2e-114	382.8	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927790.1
GTGTAACCGTATAATTGTAGTATTAATTGAACATATTAGTGTTGGATTAACATTCGCACGCATTCCCATGCGCCTCTCTCTCAAAACTGTACTGACCTCTTTCTCTCTCATCATTTCAGCGGCATTGCCCTCTCTCTCAAACCAGCTCTTCTGCAAAAAGGTTTTGGGGAAAGAGGAAAATTTGAGAAGTACTCAGGATTGGTGCTGTTTTATCTTTCCGCTTGTTGAAATGGTGGGACATTCAAATGTGGTGGTTTTGT...

XM_057927791.1
ATTAGTGTTGGATTAACATTCGCACGCATTCCCATGCGCCTCTCTCTCAAAACTGTACTGACCTCTTTCTCTCTCATCATTTCAGCGGCATTGCCCTCTCTCTCAAACCAGCTCTTCTGCAAAAAGGTGAAGGTTTTGGGGAAAGAGGAAAATTTGAGAAGTACTCAGGATTGGTGCTGTTTTATCTTTCCGCTTGTTGAAATGGTGGGACATTCAAATGTGGTGGTTTTGTGAGGGTTTAAAGGGCTATTGCTATCAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001404
ATGGGTATAACGAATTCAAAAGGTGAGAAGAGTAGTGCTTTGAAGTTGTGTAGAGAAAGGAAAAAGTTCATTAAACAAGCGATTGATTCTAGGTATGCTTTAGCAGCTGCACATGTATCGTATGTTCAGTCTCTTAGAAACCTAGGCATTGCCCTTAGGAGGTTTGCAGAGGCTGAGGTGTTGGTGGAAACCTCTCTGTCTGCTTCAGCCACAGAGCTCGATAAAACCCCCTCGCACTCGTCGTATCCTTCCCCCTCTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783773.1
MGITNSKGEKSSALKLCRERKKFIKQAIDSRYALAAAHVSYVQSLRNLGIALRRFAEAEVLVETSLSASATELDKTPSHSSYPSPSPSHLGGVSDSPVLNGSPLSTARVSYMRSGGATALTVRLNTRNSFVEEGEFSMPPPPPPPPDDSGWDYFDPADESFRFPGQDGNLDTDDAGMYGDSGKKEFDFSRGNGIYEREGSMTPKLESPTNGNGRLAAENSQQRVEGEVKDMAVGKEVSGSRGKVAGKTPVGQSNSRTNKS...

XP_057783774.1
MGITNSKGEKSSALKLCRERKKFIKQAIDSRYALAAAHVSYVQSLRNLGIALRRFAEAEVLVETSLSASATELDKTPSHSSYPSPSPSHLGGVSDSPVLNGSPLSTARVSYMRSGGATALTVRLNTRNSFVEEGEFSMPPPPPPPPDDSGWDYFDPADESFRFPGQDGNLDTDDAGMYGDSGKKEFDFSRGNGIYEREGSMTPKLESPTNGNGRLAAENSQQRVEGEVKDMAVGKEVSGSRGKVAGKTPVGQSNSRTNKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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