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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001865`

染色体: Chr08 坐标: 16006878-16009898 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001865`
名称	SmilChr08G001865
描述	uncharacterized SmilChr08G001865
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16006878 - 16009898 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001405`
GeneID	`131001405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001405`
原始查询	`LOC131001405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830875]; symbol=AT5G10110; hit=AT5G10110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830875]; symbol=AT5G10110; hit=AT5G10110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G10110` (AT5G10110) DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830875] identity=37.3; qcov=0.318; evalue=2.78e-21; confidence=low
Rice	`Os02g0752300` - identity=41.2; qcov=0.256; evalue=5.11e-21; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783775.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783775.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783775.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783775.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783775.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16007929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B91,C21,C36
`Chr8:16008146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A25,C50,C70
`Chr8:16008553`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B19
`Chr8:16008553`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927793.1
AGAAAAAAGGGAAAAATACAAAACCATGTTTTATGGAGAAAAAGCAAAAGTTACGAGCGCGCCCAAATTTCAGAATTCAAAAGATTAAGGCGGGGACCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCTTTTCTACACTCAACAATTTCCCACTGCTCCTCTTCTTCTCCAGATTGGGAACCTGCTGACGCAAAATCTCCATATAACATTTCTACAAGGTTTAGGTTTGTGAATCAGGATGCTGAGAGTTCGTTGAGGCTTGGGAAATTTT...

XM_057927792.1
TCAGAATTCAAAAGATTAAGGCGGGGACCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCTTTTCTACACTCAACAATTTCCCACTGCTCCTCTTCTTCTCCAGATTGGGAACCTGCTGACGCAAAATCTCCATATAACATTTCTACAAGGTTTAGGTCAGTTAATTATTACAGACGCGTCATTCTTAGCTGTAATTGCGTTTTTACATTTATTCAAGGTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTCTGCTCGCAGTTCAATTGACCTAAACCTAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001405
ATGGCTGACGGGAGTGTATCTCGTGGGCAGAGTAGGTCGAGGCCCGTTCTAGGTGATGTTACGAACCGGAATGGTAAAAGGGGGTTTTCAGGGAAAGAGAAGGATGGGGGAAGAAGTTTGGATTTCAATGATAAAGATACAGTCAAGCGAATTTGTGCTTCGCCTCGCCCATGTTCTGAGATTAATTCTTTGAAAGGCAATGTTATATCTGGTCTCTCCAAAATACCCGTTGAAAATAGGGAGCCTAATTTGTATGATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783775.1
MADGSVSRGQSRSRPVLGDVTNRNGKRGFSGKEKDGGRSLDFNDKDTVKRICASPRPCSEINSLKGNVISGLSKIPVENREPNLYDGSERVHSLKGKNDVIGNLKFNAGSYKHKILDLRGANTVTVSINELEVVDNDSSDGCGKSELSKNSLPRVDEVAGQNRVDPNLANLGGEGLNSVAKEADGYSPLDSLKENKISGAAEVANENRCSSLDFGMHDAIQSVNTEGNNELGESSHADTSRTVSETGTDFLHDGEENISP...

XP_057783776.1
MADGSVSRGQSRSRPVLGDVTNRNGKRGFSGKEKDGGRSLDFNDKDTVKRICASPRPCSEINSLKGNVISGLSKIPVENREPNLYDGSERVHSLKGKNDVIGNLKFNAGSYKHKILDLRGANTVTVSINELEVVDNDSSDGCGKSELSKNSLPRVDEVAGQNRVDPNLANLGGEGLNSVAKEADGYSPLDSLKENKISGAAEVANENRCSSLDFGMHDAIQSVNTEGNNELGESSHADTSRTVSETGTDFLHDGEENISP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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