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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001893`

染色体: Chr08 坐标: 16409799-16415235 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001893`
名称	SmilChr08G001893
描述	cyclin-dependent kinase C-1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16409799 - 16415235 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001418`
GeneID	`131001418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001418`
原始查询	`LOC131001418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinase C-1
产物	cyclin-dependent kinase C-1
Arabidopsis	`AT5G10270` (CDKC;1) cyclin-dependent kinase C;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830891] identity=77.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0958000` (CDKC) - identity=75.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0008353 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity); GO:0032968 (positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783790.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057783790.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057783790.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057783790.1`
5	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057783790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16410165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64
`Chr8:16410175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C16,C40
`Chr8:16410229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:16410252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:16410808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783790.1

512 aa

256

512

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-326 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 25-253 aa

XP_057783791.1

510 aa

255

510

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-324 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 25-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783790.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	326	3.1e-73	247.1	Protein kinase domain
`XP_057783790.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	25	253	7.5e-29	101.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057783791.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	324	1.8e-73	247.9	Protein kinase domain
`XP_057783791.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	25	251	4.5e-29	102.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927808.1
ACAAAGTTAAATCTAATTTCAATTTTCAACCATCTCCAAATGGGACTTCTGTTTTAACTTCTTCAGAGTTAAGGGGCATATACCGAATTTATTGTAAAGCTCAGTAGCATGCAGCTAAAACTTATAAATTGTCGTATTTAATTTAATTATAAAAATAATGCCAATCTCAACAATAAATTAAGAATTATGAATTCTTGGTTGAAGCCAATTTCAAGAAATAAAAACCAAGCTTCGACTTCTTATACGTGTTTAAAGTGAAC...

XM_057927807.1
ACAAAGTTAAATCTAATTTCAATTTTCAACCATCTCCAAATGGGACTTCTGTTTTAACTTCTTCAGAGTTAAGGGGCATATACCGAATTTATTGTAAAGCTCAGTAGCATGCAGCTAAAACTTATAAATTGTCGTATTTAATTTAATTATAAAAATAATGCCAATCTCAACAATAAATTAAGAATTATGAATTCTTGGTTGAAGCCAATTTCAAGAAATAAAAACCAAGCTTCGACTTCTTATACGTGTTTAAAGTGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001418
ATGGCGGCTACTAATCAGCTCAATGTGGAGGAGCGGCCGTCGTGGGGGTCTCGTAGTGTCGAGTGCTTCGAAAAACTCGAGCAGATTGGGGAAGGGACTTACGGTCAAGTATATATGGCCAGAGAAAAGAGAACTGGAGAGATTGTCGCTTTGAAAAAGATACGGATGGATAATGAAAAAGAGGGGTTTCCTATCACTGCAATCCGGGAAATAAAAATTCTAAAGAAGCTACAGCATGAAAATGTTATTAAGTTGAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783790.1
MAATNQLNVEERPSWGSRSVECFEKLEQIGEGTYGQVYMAREKRTGEIVALKKIRMDNEKEGFPITAIREIKILKKLQHENVIKLKEIVTSPGRESNEQVHPVTDAENNKYKGSIYMVFEYMDHDLTGLADRPGLRFTVPQIKCYMKQLLTGLHYCHVNQVLHRDIKGSNLLIDNEGNLKLADFGLARSFSNDINANLTNRVITLWYRPPELLLGATKYGPAVDMWSVGCIFAELLYGKPILPGKNEPEQLNKIFELCGT...

XP_057783791.1
MAATNQLNVEERPSWGSRSVECFEKLEQIGEGTYGQVYMAREKRTGEIVALKKIRMDNEKEGFPITAIREIKILKKLQHENVIKLKEIVTSPGRESNEQVHPDAENNKYKGSIYMVFEYMDHDLTGLADRPGLRFTVPQIKCYMKQLLTGLHYCHVNQVLHRDIKGSNLLIDNEGNLKLADFGLARSFSNDINANLTNRVITLWYRPPELLLGATKYGPAVDMWSVGCIFAELLYGKPILPGKNEPEQLNKIFELCGTPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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