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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001903`

染色体: Chr08 坐标: 16522278-16525009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001903`
名称	SmilChr08G001903
描述	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At4g39970
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16522278 - 16525009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001428`
GeneID	`131001428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001428`
原始查询	`LOC131001428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At4g39970
产物	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At4g39970
Arabidopsis	`AT4G39970` (AT4G39970) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830158] identity=78.9; qcov=0.818; evalue=3.15e-154; confidence=high
Rice	`Os08g0485900` - identity=75.8; qcov=0.792; evalue=7.16e-140; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF13419 (HAD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783809.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057783809.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783809.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783809.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16522771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:16522785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B25,B40
`Chr8:16522920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:16523012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:16523023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:16523029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:16523166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B21
`Chr8:16523193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B21
`Chr8:16523546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr8:16523560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:16523819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C80
`Chr8:16523824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A25,B75,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783809.1

313 aa

156

313

Hydrolase

HAD_2

PF00702 Hydrolase 60-268 aa PF13419 HAD_2 158-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783809.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	60	268	3.2e-23	83.8	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783809.1`	Pfam	`PF13419`	HAD_2	Family	158	272	6.4e-21	75.9	Haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093929.1
CAAACAAAACGGTCGTTATATCGGTTACCAACTGAAAAGGTCTCAGCCACACACACAACACACACAATCCATGGCTTCTTCCGCCGTCTTCCTCTTCCCACCCAACCTCTCTGCCCCTCCCTCTCTCTCCTCCCGCACTCCTCTGTTCTCTCTCTGCAGAACTAATCACACCATCTCCGCCGCAACTGCAAGAAGCAGCAGCTGCAGACGCCTAGTAGTGACAGCCTCAGCCTCATCTAGGGCTCTTGAAGCTCTGATTT...

XM_057927826.1
TCAAAACACCAAACAAAACGGTCGTTATATCGGTTACCAACTGAAAAGGTCTCAGCCACACACACAACACACACAATCCATGGCTTCTTCCGCCGTCTTCCTCTTCCCACCCAACCTCTCTGCCCCTCCCTCTCTCTCCTCCCGCACTCCTCTGTTCTCTCTCTGCAGAACTAATCACACCATCTCCGCCGCAACTGCAAGAAGCAGCAGCTGCAGACGCCTAGTAGTGACAGCCTCAGCCTCATCTAGGGCTCTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001428
ATGGCTTCTTCCGCCGTCTTCCTCTTCCCACCCAACCTCTCTGCCCCTCCCTCTCTCTCCTCCCGCACTCCTCTGTTCTCTCTCTGCAGAACTAATCACACCATCTCCGCCGCAACTGCAAGAAGCAGCAGCTGCAGACGCCTAGTAGTGACAGCCTCAGCCTCATCTAGGGCTCTTGAAGCTCTGATTTTCGACTGCGACGGCGTAATTCTGGAGTCGGAGCATCTCCACCGCCAAGCCTACAACGACGCATTTGCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783809.1
MASSAVFLFPPNLSAPPSLSSRTPLFSLCRTNHTISAATARSSSCRRLVVTASASSRALEALIFDCDGVILESEHLHRQAYNDAFAHFNVRCPSSPSSGPLDWTPEFYDELQNQIGGGKPKMRWYFKEHGWPTSTVSDAAPESDEDRAKLIDILQDWKTERYKEIIKSGTVEPRPGVLRLMDEAKASGRKLAVCSAATKSSVVLCLENLIGLERFQSLDCFLAGDDVKEKKPDPMIYVTAAKKLGVSEKNCLVVEDSVIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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