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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001879`

染色体: Chr08 坐标: 16243373-16246774 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001879`
名称	SmilChr08G001879
描述	protein SCO1 homolog 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16243373 - 16246774 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001429`
GeneID	`131001429`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001429`
原始查询	`LOC131001429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SCO1 homolog 2, mitochondrial
产物	protein SCO1 homolog 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G39740` (HCC2) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830129] identity=54.2; qcov=0.774; evalue=6.71e-91; confidence=high
Rice	`Os09g0370200` - identity=55.6; qcov=0.668; evalue=1.39e-82; confidence=high
GO	GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	-
Pfam	PF02630 (SCO1-SenC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001429

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057783810.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057783810.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057783810.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783810.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16243697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B74,B77,C19,C2,C40
`Chr8:16243751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:16243757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:16244479`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr8:16244479`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr8:16246444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783810.1

310 aa

155

310

SCO1-SenC

PF02630 SCO1-SenC 141-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783810.1`	Pfam	`PF02630`	SCO1-SenC	Domain	141	300	6.9e-51	173.0	SCO1/SenC

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927827.1
TGCTTTAAAAATAAAAAGCCCATTAAATCCACCCTGATATTTGGGCTACGCTGGCTCTGACTTGTTCTTGAAGAAAAAGAAAGCTAATGCAGACGGCGTCAGCTACACCTGCTGAACAAATTTCAATTTTTACCTATTTATCCATATAATTGATATCACAGACATGAAATTTCTTGGTTCAATTGAACGGAATTTATTAGGTTTTTTCTCCCTTTTGTGCTGAGGTAGTAGTAGTAATTTGTAGGTTAATCGTATCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001429
ATGCCATTGCTATCTAAAGCTGTCTTCGCTGCCAAAAACCATGCGGAATCATCTCTCCAGGTTTTCAAAGGGTTTGGTTTGTCAAAGAGATTTTTCTCATCAATGTCCAGAAGGCCCGCCTCAAAAAATTTATCTTCTCATCCATTGACTAAACAAACAATGGTGGCAGATCATGAGGGTCTGAACTGTTTCACGAAGTATGGTTTATCTAACAGATACTATTGTAGCAAAACAAGGTCCACAAACAGTATTAAGACTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783810.1
MPLLSKAVFAAKNHAESSLQVFKGFGLSKRFFSSMSRRPASKNLSSHPLTKQTMVADHEGLNCFTKYGLSNRYYCSKTRSTNSIKTSPLPEQAGTNWRSFLIPGLALGGIGGLFCLVHYNDERRAVLKGKGVKFERSAFQGPIIGGPFSLIDTEGRLVTEKNLLGNWVLLYFGYTSSPDVGPAELRKMANAINILESKQNIKVLPIFVTIDPQRDTPSHLRAYIQEFDSRIVGLTGPAAAIRQMAQEYRVFFRKVDEEGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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