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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001924`

染色体: Chr08 坐标: 16778096-16780153 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001924`
名称	SmilChr08G001924
描述	histone H3.3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16778096 - 16780153 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001463`
GeneID	`131001463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001463`
原始查询	`LOC131001463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H3.3
产物	histone H3.3
Arabidopsis	`AT4G40030` (AT4G40030) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830164] identity=100; qcov=1; evalue=1.39e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0390600` (H3) - identity=100; qcov=1; evalue=9.47e-97; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783839.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057783839.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057783839.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783839.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16778436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B49,C13,C85
`Chr8:16778462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B49,C13,C85
`Chr8:16778475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B115,B49,C13,C85
`Chr8:16778478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B49,C13,C85
`Chr8:16778643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr8:16778646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr8:16778682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783839.1

136 aa

136

Histone

PF00125 Histone 44-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783839.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	44	131	8.2e-39	132.6	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927856.1
AGATCAGTCCCCTTCGAAAAAACAAAAAATTAAAATAAGAGAGGAGACATTAATAAGATAAGACTCATAATTTTTAATTAGGCCTTGATATGCCAAACTCAGAAATCAGTATTTACGAATATCAACCAATGAGAATCGTGTATTAAGCCATCTCGATCCGCGTCATAGCACGAATCGGCTAATCGGAGCCGTACATTTAATGTGAAGAAACACAAAGTGCCCCACGCGACACCGTCAGATTCGACCAGGAAAGGACCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001463
ATGGCTCGTACCAAGCAGACTGCCCGTAAATCAACTGGAGGAAAAGCTCCCAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCTCGTAAGTCTGCCCCAACCACTGGTGGAGTGAAGAAGCCTCACAGATACCGCCCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATTCGCAAGTATCAGAAGAGTACTGAGCTTTTGATCAGGAAGTTGCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAAATTGCCCAGGACTTCAAGACTGATCTGCGTTTCCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783839.1
MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPTTGGVKKPHRYRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSHAVLALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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