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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001925`

染色体: Chr08 坐标: 16781300-16787525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001925`
名称	SmilChr08G001925
描述	uncharacterized SmilChr08G001925
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16781300 - 16787525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001464`
GeneID	`131001464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001464`
原始查询	`LOC131001464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal transducer, putative (DUF3550/UPF0682) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830168]; symbol=AT4G40050; hit=AT4G40050; species=arabidopsis; confidence=high
产物	signal transducer, putative (DUF3550/UPF0682) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830168]; symbol=AT4G40050; hit=AT4G40050; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G40050` (AT4G40050) signal transducer, putative (DUF3550/UPF0682) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830168] identity=62.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0470900` (OJ1595_D08.27-1) - identity=50.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003714 (transcription corepressor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF12070 (SCAI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783840.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057783840.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783840.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783840.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16782867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr8:16782898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:16782968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr8:16783873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B27,C16,C40,C76
`Chr8:16784429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr8:16784733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B140,B29,C8,C82
`Chr8:16786342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:16786606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr8:16786738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783840.1

600 aa

300

600

SCAI

PF12070 SCAI 14-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783840.1`	Pfam	`PF12070`	SCAI	Family	14	553	5.3e-187	623.6	Protein SCAI

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927857.1
ACAAATTGGGACCGAGGTAGTATTTGTAGTTTAAAATTGTTTTCCTTCCTCTCAAAATGGTAGGGGGCTCCATAGATAACAACGAAAAGAGTACAAAATCAACTAACGCCTTAAATGAAATCGAAACCGCATCGCTCTCTCCCTCCCTCTCTCACACACTCATACACACATATACACGCACTTGCATTGGACACGCACGCTCGCTCACGCACTCTTTGTCTACATCTCTCTCTCTCTCACACACAGAATCCTCACCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001464
ATGTCGAGAGAGGAAGACGCGCCGAAGACATTCCGCGTTCTCGTGGAGAACGCGGAGCGGAAGTTCGCGCGCGTGCGCGACGCGCCGCTGCATCCGTACGGCGGGAGTGGGCCCCAGTACGGGCACTTCTTCCACAAGGTTTTCAAGGCTTACATGCGGCTGTGGAAGTACCAGCAGGAGAATAGGGCCAAATTGACGGAATCGGGCCTCCAGCGGTGGGAGATTGGGGAGATCGCTTCGCGAATCGGTCAGCTCTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783840.1
MSREEDAPKTFRVLVENAERKFARVRDAPLHPYGGSGPQYGHFFHKVFKAYMRLWKYQQENRAKLTESGLQRWEIGEIASRIGQLYFNQYLRTSEARFLLEAYIFYEAIFNRRYFEGSSKDRGVRFKELRFYARFLMVSLIMNHVEMVKLLVQRFKDLVDDSKVNFRGTNFKEWRLVVQEIMRFTEADSGNASARPLRYTVMFDSYPASLPYVARFHAKRLLKFRDALLTSYHKNEVKFAEQTLDTFRMLQSLEWEPSGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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