当前解析结果
SmilChr01G001131| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001131 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001131 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001131 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 23005937 - 23007193 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001482 |
|---|---|
| GeneID | 131001482 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001482 |
| 原始查询 | LOC131001482 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001482 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783887.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057783887.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057783887.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057783887.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783887.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:23005941 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B73,C17,C84 |
Chr1:23005978 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr1:23005982 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 37 | A10,A19,A22,B102,B103,B109,B112,B122,B130,B14,B16,B26,B3,B32,B35,B36,B51,B59,B70,B74,B78,B83,B86,B95,B98,C19,C23,C24,C27,C28,C39,C46,C57,C71,C73,D1,D5 |
Chr1:23005984 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B49,B68,B93 |
Chr1:23005990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr1:23006009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B120,B25,B78,C2 |
Chr1:23006009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B25,B78,C2 |
Chr1:23006017 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A19,B139,B76,C47 |
Chr1:23006042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B63,D10 |
Chr1:23006043 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A10,B131,B134,B92,C35,C84,D6 |
Chr1:23006045 |
GGA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A10,B131,B134,B92,C35,C84,D6 |
Chr1:23006058 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。