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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001947`

染色体: Chr08 坐标: 17142685-17145337 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001947`
名称	SmilChr08G001947
描述	cyclin-D4-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17142685 - 17145337 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001486`
GeneID	`131001486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001486`
原始查询	`LOC131001486`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-D4-2-like
产物	cyclin-D4-2-like
Arabidopsis	`AT5G65420` (CYCD4;1) CYCLIN D4;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836667] identity=46.9; qcov=0.761; evalue=4.97e-84; confidence=high
Rice	`Os09g0466100` (CycD2) - identity=44.2; qcov=0.832; evalue=5.89e-75; confidence=medium
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783857.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783857.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783857.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783857.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17143124`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A16,A18,A6,B10,B106,B112,B12,B125,B126,B129,B131,B135,B16,B23,B27,B28,B31,B33,B35,B42,B43,B49,B52,B65,B67,B74,B75,B76,B79,B83,B89,B93,B95,B98,C12,C13,C2,C22,C29,C32,C33,C34,C4,C42,C44,C47,C49,C51,C59,C61,C68,C73,C76,C85,C9,D10,D11,D6,D7
`Chr8:17143258`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A8,B109,B119,B12,B13,B131,B136,B27,B49,B55,B60,B7,B71,B76,B80,B89,B91,C22,C3,C41,C42,C54,C64,C71,C81,C87
`Chr8:17143271`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:17143271`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17143274`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:17143274`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17143304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B140,B91,C21,C36
`Chr8:17143329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B140,B91,C21,C36
`Chr8:17143335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:17144312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:17144867`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B132,B140,B27,B41,B47,B57,C22,C46,C51,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783857.1

381 aa

190

381

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 71-207 aa PF02984 Cyclin_C 211-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783857.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	71	207	1.8e-28	99.5	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057783857.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	211	316	1.8e-11	44.8	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927874.1
TACACAAATCCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTAAATATATATGTATATATATGCACCCCACCCCAATCCAATAGTCTCACTTCCAGTCCTCTCTCTCTCTCTGGGCCTTGTTGCAGAAATGGCAGAAACATAATACCAATCTTTAGCATGCAAAAGAAACCCCATCAAAAACCCATCTTTTGATAACTTCCATTGACAGCAAAGCACATTCATTGAGGCTGATTTCCCAATGGCTGATTACAACGCCTTTGACTCTGCTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001486
ATGGCTGATTACAACGCCTTTGACTCTGCTACTTCAACAGACCTCCTCTTCTGTAACGAAGAAACCAAAGCCTTTTGTTTCGACGACAACGATGATTATCATGTTCTTCAACCTTCCACCCACCAAAATATAGCTGAAAAAGATTTGATTTTTAGCAATGGGGCATCAGATTCAGAGGCACTCCTTCATCTTCCTTGCCTCAGTGAAGAGTGCATTGGCTACATGTTAGAGAGAGAGAGAGAGCACCTACCAAGAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783857.1
MADYNAFDSATSTDLLFCNEETKAFCFDDNDDYHVLQPSTHQNIAEKDLIFSNGASDSEALLHLPCLSEECIGYMLEREREHLPRDDYLARLRNGELDVGLRREALDWMFKACAHFSFGELCLYSAISYFDRFLSIYELPLSSSEKGSKNWAVQLVAVACLSLAAKIEEVNVPSTLDLQAGVPKLLFEGKTIQRMEILVLNSLNWKIKAYTPCNFIDYYLRKMNEGGEPLGLVISRSLRLIMSTIEGIEFLEFKPSEIAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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