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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001949`

染色体: Chr08 坐标: 17166187-17168595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001949`
名称	SmilChr08G001949
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1D, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17166187 - 17168595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001488`
GeneID	`131001488`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001488`
原始查询	`LOC131001488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1D, chloroplastic-like
产物	protein CURVATURE THYLAKOID 1D%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G38100` (AT4G38100) CURVATURE THYLAKOID 1D-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829966] identity=41.9; qcov=0.766; evalue=6.49e-32; confidence=medium
Rice	`Os09g0465800` - identity=51.7; qcov=0.426; evalue=1.67e-29; confidence=low
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009579 (thylakoid)
KEGG	-
Pfam	PF14159 (CAAD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001488

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783860.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057783860.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057783860.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057783860.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17166971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C86
`Chr8:17166974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C86
`Chr8:17166976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:17166997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B98,C44,C86
`Chr8:17167023`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B112,B98,C44,C86
`Chr8:17167023`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B112,B98,C44,C86
`Chr8:17167116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B112,B98,C44,C86
`Chr8:17167116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B98,C44,C86
`Chr8:17167133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C44,C86
`Chr8:17167973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C86
`Chr8:17167981`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B98,C86
`Chr8:17167981`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B98,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783860.1

210 aa

105

210

CAAD

PF14159 CAAD 130-206 aa

XP_057783861.1

209 aa

104

209

CAAD

PF14159 CAAD 129-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783860.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	130	206	9.6e-27	93.4	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase
`XP_057783861.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	129	205	9.8e-27	93.4	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927877.1
TTGAACGAATAAAAAAAAATTGAAAAAGGATTTACAGCTTCCTCGTGTTTCGCATTTTACTCGATAAACCCGAAGTTAAACCCTAGCAATTATCCTATTTATTTCCAACAACCCTAACCCTTTTTTCTTCCAAATTCGACCATGATCGAAAGCATGAAGCTGTGCACAGCTCGAGGCATCTCGAGTGTTACTTCGATCCAGCCGAAGCTTCTCGCTCCTAATCAAATTCAGCCCGTTCATTGCAACAATCAATTTCATTT...

XM_057927878.1
AATAAAAAAAAATTGAAAAAGGATTTACAGCTTCCTCGTGTTTCGCATTTTACTCGATAAACCCGAAGTTAAACCCTAGCAATTATCCTATTTATTTCCAACAACCCTAACCCTTTTTTCTTCCAAATTCGACCATGATCGAAAGCATGAAGCTGTGCACAGCTCGAGGCATCTCGAGTGTTACTTCGATCCAGCCGAAGCTTCTCGCTCCTAATCAAATTCAGCCCGTTCATTGCAACAATCAATTTCATTTCGTGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001488
ATGATCGAAAGCATGAAGCTGTGCACAGCTCGAGGCATCTCGAGTGTTACTTCGATCCAGCCGAAGCTTCTCGCTCCTAATCAAATTCAGCCCGTTCATTGCAACAATCAATTTCATTTCGTGCTCAAGCAAACCCGATTCAATTCAGTAGGATTGAGGTGCCGTACTAATTTATCTCTGAGGTCGTCAACCACATCTGAGGAGACAGGGAGAACTCCCTACGATGTGGATGAACCTGAAGCTGATGGTGAGATAAATGT...

LOC131001488
ATGATCGAAAGCATGAAGCTGTGCACAGCTCGAGGCATCTCGAGTGTTACTTCGATCCAGCCGAAGCTTCTCGCTCCTAATCAAATTCAGCCCGTTCATTGCAACAATCAATTTCATTTCGTGCTCAAGCAAACCCGATTCAATTCAGGATTGAGGTGCCGTACTAATTTATCTCTGAGGTCGTCAACCACATCTGAGGAGACAGGGAGAACTCCCTACGATGTGGATGAACCTGAAGCTGATGGTGAGATAAATGTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783860.1
MIESMKLCTARGISSVTSIQPKLLAPNQIQPVHCNNQFHFVLKQTRFNSVGLRCRTNLSLRSSTTSEETGRTPYDVDEPEADGEINVETIDLGEKKEDYETQPNEAPQEGSLVDNLQFLKFLEEFDIKFDYEDTSSILVFGGGGAVALWLAAAVVGAIDSIPLVPKVLELVGLGYTVWFSSRYLIFKKNRDELIATVEQIKQQVLGSKDN

XP_057783861.1
MIESMKLCTARGISSVTSIQPKLLAPNQIQPVHCNNQFHFVLKQTRFNSGLRCRTNLSLRSSTTSEETGRTPYDVDEPEADGEINVETIDLGEKKEDYETQPNEAPQEGSLVDNLQFLKFLEEFDIKFDYEDTSSILVFGGGGAVALWLAAAVVGAIDSIPLVPKVLELVGLGYTVWFSSRYLIFKKNRDELIATVEQIKQQVLGSKDN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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