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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001957`

染色体: Chr08 坐标: 17224452-17231730 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001957`
名称	SmilChr08G001957
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17224452 - 17231730 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001496`
GeneID	`131001496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001496`
原始查询	`LOC131001496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17
Arabidopsis	`AT5G65450` (UBP17) ubiquitin-specific protease 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836670] identity=57.9; qcov=0.433; evalue=4.38e-151; confidence=low
Rice	`Os08g0478500` - identity=49.7; qcov=0.526; evalue=5.43e-139; confidence=medium
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF01753 (zf-MYND); PF13423 (UCH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783867.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057783867.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783867.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783867.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17224887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr8:17225021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B21,B79,C54
`Chr8:17227293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B110,B56,B96,C20
`Chr8:17227364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17227491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr8:17227548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17227601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17227738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:17228775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B33
`Chr8:17229189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B19,C30,C50,C75
`Chr8:17229457`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	243	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:17229463`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	243	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783867.1

937 aa

468

937

zf-MYND

UCH

UCH_1

PF01753 zf-MYND 75-112 aa PF00443 UCH 517-811 aa PF13423 UCH_1 518-793 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783867.1`	Pfam	`PF01753`	zf-MYND	Domain	75	112	1.8e-08	35.0	MYND finger
`XP_057783867.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	517	811	1e-49	170.2	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057783867.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	518	793	6e-15	56.4	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927884.1
AAAATTCAAAAAAGGAAATAGGAAAAATGGAAAAGGAAAAAAAAGAAGCAGAAATAGAATAGGGTAGAAATTCCCACCCAACCAAACAGGTTACAGGTTCTAATCTCTATCTCTACGTTACTTTCCTATATTCTCTCTTTTTTCTATTTGGGTATTTTTTTCACAATCCACTCTCACCAAAATTCCGTTTCTTCCGTTTTCAATTTTACCTTCCTCCTCCGCCACCGTCCGCGGCCGGCGTCGCCGTCGTTACAACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001496
ATGCTAGTAATTGTCGGTATATTACTGCTTTTCGGTCTTGTAGTTCGGCATAAGTGGCGGAATGGGGCGGCGAAGAAGGAGGCGATTCTGAGGCTGGTGGCCGTCGCCTCGGAAGAAGAAGCACAAATTGCTAAGCTACAAGCTGTTGAGCAGTACAATTCTCAGCACGTAGAGTACACGCCGCAGCCCAGTAATACGCAGCAGCTCGAAGCGCAGCATTTTTGTGCCGTTTGTCGTTGCCCCACCACCACTAGGTGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783867.1
MLVIVGILLLFGLVVRHKWRNGAAKKEAILRLVAVASEEEAQIAKLQAVEQYNSQHVEYTPQPSNTQQLEAQHFCAVCRCPTTTRCSRCKAVRYCSGKCQIIHWRQGHRDECQPAVALYATKKSEYVVETAPENQFTMHLKNESKICSDPSNDCDDSGSSGSSTSSFFSSTDQSEASADASTNEDVECRPALALHARMKSDFVVETAPEFAMHLKDEIKISDPSEECDDSGSSGSSVSCFLSSTKQSEMCFDASTDEHVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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