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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001979`

染色体: Chr08 坐标: 17499411-17503838 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001979`
名称	SmilChr08G001979
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor AIL6
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17499411 - 17503838 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001514`
GeneID	`131001514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001514`
原始查询	`LOC131001514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor AIL6
产物	AP2-like ethylene-responsive transcription factor AIL6
Arabidopsis	`AT5G10510` (AIL6) AINTEGUMENTA-like 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830915] identity=52.4; qcov=1.22; evalue=3.14e-160; confidence=high
Rice	`Os01g0899800` (OsPLT5) - identity=67.6; qcov=0.565; evalue=1.26e-123; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17500508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C25
`Chr8:17500529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:17500850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B18,B58,C72,D9
`Chr8:17500968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:17502363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:17503069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:17503178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:17503241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:17503253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,B9,C23,C48
`Chr8:17503367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C30,C50,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783893.1

492 aa

246

492

AP2

PF00847 AP2 216-273 aa PF00847 AP2 318-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783893.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	216	273	2e-21	76.7	AP2 domain
`XP_057783893.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	318	367	2e-21	76.7	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927910.1
TGCTTAACTTATTCAACTAGTTACCTAGCCTACCTCTCGTTTTTTTCTTTTTTAATCTTCCCTTCTCACACTTGAACGTTTTTAATATAAACACCAAGCCTTCTCACTCAGTTTTACTTCTTCCGTGTGATTGCTAGCTGTTGATTGAGTCATTTTTACTGCCTTTGTTTGCATGTGCTCTTCTCCTCTTCCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCATTCTTGAATGTACTAGTAATAAATAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001514
ATGGCGCCCGACAACAACTGGCTCTCTTTCTCTCTCTCTTCAATGGAAATGCTCAACTCCTCCTCCTCATCTTCTTCTCAGCCTAATGATCCCCACCATTACTATTCCTTCGGAGATAACTTCTACACAACTGGGTGGCCGAACCACAAAGGCGCCGGCGCGATGTACGCGGAAGCCGACAATCAGCATCAAGTGAAGGAGCAGCAGCAACACAACGCCGCCATTTACACCAGCTACATGCAGCAGCCGCCCCCTAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783893.1
MAPDNNWLSFSLSSMEMLNSSSSSSSQPNDPHHYYSFGDNFYTTGWPNHKGAGAMYAEADNQHQVKEQQQHNAAIYTSYMQQPPPKLEDFFAGGGDSTETQDSSLTHIYDHHHADGGGAYFGGGEQQDLKSIIGFQAFSANSGSNVDDSAFAGQTQSPVESATELAAYSHCPVTATANGLSLDVNINNDNNKAVVSTDSDSCKKIADTFGQRTSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDNSCRREGQARKGRQVYLGGYDKEDKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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