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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002113`

染色体: Chr08 坐标: 18978743-18987632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002113`
名称	SmilChr08G002113
描述	phospholipase D delta-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18978743 - 18987632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001535`
GeneID	`131001535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001535`
原始查询	`LOC131001535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase D delta-like
产物	phospholipase D delta-like
Arabidopsis	`AT4G35790` (PLDDELTA) phospholipase D delta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829733] identity=68.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0543100` (OsPLDdelta1) - identity=65.2; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004630 (D-type glycerophospholipase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009395 (phospholipid catabolic process); GO:0046470 (phosphatidylcholine metabolic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF00614 (PLDc); PF13091 (PLDc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783922.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783922.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783922.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057783922.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057783922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18979009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A25,B123
`Chr8:18979171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18980661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr8:18980661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:18982470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B91,C40,D10,D11
`Chr8:18982996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B104,B29,B33
`Chr8:18984473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:18986231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:18986464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B91,C40,D10,D11
`Chr8:18986470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B91,C40,D10,D11
`Chr8:18986692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,B16,C46,C58
`Chr8:18986718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783922.1

862 aa

431

862

PLDc

PLDc_2

PF00168 C2 64-154 aa PF00614 PLDc 246-850 aa PF13091 PLDc_2 695-744 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783922.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	64	154	7.6e-20	71.8	C2 domain
`XP_057783922.1`	Pfam	`PF00614`	PLDc	Domain	246	850	5.7e-214	712.3	Phospholipase D
`XP_057783922.1`	Pfam	`PF13091`	PLDc_2	Domain	695	744	3e-09	37.5	Cardiolipin synthase, PLD-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927939.1
ATTTAAACCAAAAATTTACCAAGAGCAGCTCTAATTGTAATTTCTCTTTATGTTTTTTTTTTTATATGTTTGAGATTTTCTCTTATTGAATAGGAGAATTACGATCGATATATATCTTGTGTAGTTTTATTTTCTTTTAATTTCATTCGCACTAAAATGGAGTACGAGATCTTATTACAGTTGTATTGTATCCGTTACAGAGACAAATCTAATTAAAAGAATAGTGATATTGATATATCCTATGCTGTGTTGTCACTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001535
ATGGCGGCGGACGAGCCGGCGGTGCTCTACTTGCATGGAGATTTGGAGCTCCACATCTTCGAGGCGCGCTCGCTCCCAAACATGGACCTCTTCTCCGAGCGCCTCCGCTGCTGCTTCACCGCCTGCCAAACCGGCGGCGAAGCCGACGTCTACGCCAGCGGCGGGAGCAAGGCCAGCAGCCGCCACGACAGGAAGCTCCACCACCACCGGAAGATCATCACCAGCGATCCCTACGTCACCATCTCCGTCCCCCAGTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783922.1
MAADEPAVLYLHGDLELHIFEARSLPNMDLFSERLRCCFTACQTGGEADVYASGGSKASSRHDRKLHHHRKIITSDPYVTISVPQSTLARTRVISNSQNPKWNERFHIPLAHPVANLEIRVKDNDVFGADTMGKILIPAEKIATGEELSDWFPLIAPSGKPPKPDTALRIKMIFTPCAKNPMYKHGVAGDPKYRGVRNTYFPLRKGSTVTLYQDAHVRDADNMPKIELDDGLTRYHAPCWEDICYAITEAHHLIYITGWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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