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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001997`

染色体: Chr08 坐标: 17715238-17721032 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001997`
名称	SmilChr08G001997
描述	uncharacterized SmilChr08G001997
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17715238 - 17721032 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001546`
GeneID	`131001546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001546`
原始查询	`LOC131001546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Rhamnogalacturonate lyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837521]; symbol=AT1G09890; hit=AT1G09890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Rhamnogalacturonate lyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837521]; symbol=AT1G09890; hit=AT1G09890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G09890` (AT1G09890) Rhamnogalacturonate lyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837521] identity=52.2; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0554100` - identity=49.5; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF06045 (Rhamnogal_lyase); PF14683 (CBM-like); PF14686 (fn3_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057783983.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057783983.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783983.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783983.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17715407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr8:17715530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:17715551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:17715581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:17715820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:17716008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B122
`Chr8:17716211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C61
`Chr8:17716261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:17716277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B28,B79
`Chr8:17716279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:17716337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:17716339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783983.1

685 aa

342

685

Rhamnogal_lyase

fn3_3

CBM-like

PF06045 Rhamnogal_lyase 40-236 aa PF14686 fn3_3 397-468 aa PF14683 CBM-like 483-675 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783983.1`	Pfam	`PF06045`	Rhamnogal_lyase	Family	40	236	1.3e-74	250.9	Rhamnogalacturonate lyase family
`XP_057783983.1`	Pfam	`PF14686`	fn3_3	Domain	397	468	1e-20	74.0	Polysaccharide lyase family 4, domain II
`XP_057783983.1`	Pfam	`PF14683`	CBM-like	Domain	483	675	3.9e-44	151.1	Polysaccharide lyase family 4, domain III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928000.1
TAAAAAAACAAAGTAGGTGTGGTGCAAAAATTTGAAAGAAATGAAAATGTTGATGAAGCTGCCACAATTCTGGTGGGTTGGATTGGCTCTGCACCTATTGTTTTTGCCTATTTATTCTCAGAATGTTCACAGACGAGTGCTCATCAATGATACAATTGAAGCTGATTCGGCATCTCAAGGACTACAACTGGTTCAACAGGCTAACCATGTTGTAATGAGTAATGGAATAGTTAGCATCACAATTAGCTCACCAGGCGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001546
ATGAAAATGTTGATGAAGCTGCCACAATTCTGGTGGGTTGGATTGGCTCTGCACCTATTGTTTTTGCCTATTTATTCTCAGAATGTTCACAGACGAGTGCTCATCAATGATACAATTGAAGCTGATTCGGCATCTCAAGGACTACAACTGGTTCAACAGGCTAACCATGTTGTAATGAGTAATGGAATAGTTAGCATCACAATTAGCTCACCAGGCGGTTCCGTCACCAATATAACATACAAAGGAAGTGACAATTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783983.1
MKMLMKLPQFWWVGLALHLLFLPIYSQNVHRRVLINDTIEADSASQGLQLVQQANHVVMSNGIVSITISSPGGSVTNITYKGSDNLLLVREEESDRGHWNVVWNEALGGIDHIDNLEGTDFKVILQNENQIEISFTRTWSSAGSLAPLNVDKRYVMLRGSPGFYTYVVLERLKGWPSFRIQEGRIVFKLQENKFRYMAMSDERQRLMPTPEDRKSGEPLAYKEAVLLTNPEFKGEVDDKYMYSCDNKDNKVHGWVSNDTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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