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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002188`

染色体: Chr08 坐标: 19766244-19768683 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002188`
名称	SmilChr08G002188
描述	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19766244 - 19768683 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001553`
GeneID	`131001553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001553`
原始查询	`LOC131001553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 2
产物	protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 2
Arabidopsis	`AT1G66840` (PMI2) PLASTID MOVEMENT IMPAIRED protein (DUF827) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843002] identity=37.9; qcov=0.987; evalue=1.18e-95; confidence=medium
Rice	`Os01g0692300` - identity=36.6; qcov=0.8; evalue=1.98e-52; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05701 (WEMBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057783994.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783994.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057783994.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057783994.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19766636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B9,C32,C68
`Chr8:19766757`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B113,B28,B36,B40,B58,B71,C15,C64,C81
`Chr8:19766763`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B113,B28,B36,B40,B58,B71,C15,C64,C81
`Chr8:19766766`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B113,B28,B36,B40,B58,B71,C15,C64,C81
`Chr8:19766951`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B113,B48,B73,C77,C9
`Chr8:19766951`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B113,B48,B73,C77,C9
`Chr8:19767085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C19,D6
`Chr8:19767098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:19767130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B66,B8
`Chr8:19767229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:19767299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:19767574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783994.1

625 aa

312

625

WEMBL

PF05701 WEMBL 18-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783994.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	18	549	1.4e-18	67.7	Weak chloroplast movement under blue light

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928011.1
CTTAATCACACTCAAAACACGCATTAACGATAAGCCCCGGTGATCAAACATATGGCTCTCTCTCTACTGTGTGCGTGTCTGCATTACAGCACCATGTTACCGAGGGCTCCACTGCGGAAAATTCCAATGCCTGGTGATGCCACCAATAACACCCAATTACCCTCCACTTTATCTCTCTCTCTCACTACACCTCCAAATTTCCCATTTCTAACTCATAGTTTCATTGTTTGCATTCTTTAATCATAGGAGAACTTCTAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001553
ATGACGGACATGGAGAAGCCGGCCGACGCCGAGGCCGATACAAGGCCTGGCTCGGTCAAGGCAGCCGTGAGTTCTTACCGCAAGCGAATCAGTGAAGGAAACTCCAAACTCAGCAAATTCCAAACAAATTTGCAAGAGAAGCCTTTCGTCAAAACAAGAGAGCTCCATTGGGCGAAGAGAGACACTAACCTGTTAGCCGAGAGCAGAAAAAACGCAGAGTTGGTAACTGCTGAAGCGAGATCCGAGCTGTTTGCTGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783994.1
MTDMEKPADAEADTRPGSVKAAVSSYRKRISEGNSKLSKFQTNLQEKPFVKTRELHWAKRDTNLLAESRKNAELVTAEARSELFAAKKMAKDLKRRIEESNARAKSQMEDLEKLQMGEREQEEWKNANFECEKVMRELEMVKRELSKLKMDMASAMEERRRAEKEMNESMSKRESYLSSAESLNKEIEEINEEHVLVELARIEAIKEYEQIEAQTRDEAEMHASAIEVFQKKKQNMIDEVEEAKELEERLMITTSDISML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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