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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002044`

染色体: Chr08 坐标: 18268790-18275492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002044`
名称	SmilChr08G002044
描述	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18268790 - 18275492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001554`
GeneID	`131001554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001554`
原始查询	`LOC131001554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease 2-like
产物	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease 2-like
Arabidopsis	`AT4G36050` (AT4G36050) endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829761] identity=56.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0536000` - identity=47.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003906 (DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0008311 (double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783995.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057783995.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057783995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18271049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B11,C51
`Chr8:18273515`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B134
`Chr8:18273515`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B134
`Chr8:18275203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:18275432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783995.1

610 aa

305

610

Exo_endo_phos

Zn_ribbon_GRF

PF03372 Exo_endo_phos 4-271 aa PF06839 Zn_ribbon_GRF 554-603 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783995.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	271	1.8e-20	74.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057783995.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	554	603	4.5e-11	43.4	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093966.1
AGCGTAAAATGAACCCAAAAGAAGGTGAAGAATGAAGATAGTGACGTACAACGTAAACGGGCTGAGACCTCGAATCTCACAGTTCGGCTCTCTTCGCAAATTGCTCGATTCCTTTGACGCCGACATCATCTGCTTCCAGGAAACAAAGCTCTCGAGGCAAGAGTTTAGAGCTGATTTGGTGCAGGCTGAGGGTTACGAGTCCTTTATCTCTTGCACTCGCACTACTGAGAAAGGCCGAACTGGATATTCTGGTGTGGCGA...

XR_009093967.1
AGCGTAAAATGAACCCAAAAGAAGGTGAAGAATGAAGATAGTGACGTACAACGTAAACGGGCTGAGACCTCGAATCTCACAGTTCGGCTCTCTTCGCAAATTGCTCGATTCCTTTGACGCCGACATCATCTGCTTCCAGGAAACAAAGCTCTCGAGGCAAGAGTTTAGAGCTGATTTGGTGCAGGCTGAGGGTTACGAGTCCTTTATCTCTTGCACTCGCACTACTGAGAAAGGCCGAACTGGATATTCTGGTGTGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001554
ATGAAGATAGTGACGTACAACGTAAACGGGCTGAGACCTCGAATCTCACAGTTCGGCTCTCTTCGCAAATTGCTCGATTCCTTTGACGCCGACATCATCTGCTTCCAGGAAACAAAGCTCTCGAGGCAAGAGTTTAGAGCTGATTTGGTGCAGGCTGAGGGTTACGAGTCCTTTATCTCTTGCACTCGCACTACTGAGAAAGGCCGAACTGGATATTCTGGTGTGGCGACATTTTGCCGTGTCAACTCTGTGTTTTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783995.1
MKIVTYNVNGLRPRISQFGSLRKLLDSFDADIICFQETKLSRQEFRADLVQAEGYESFISCTRTTEKGRTGYSGVATFCRVNSVFSSDEVSLPVSAEEGFTGVLKDFSGSGYRNIEYSPLTAEDVSADELLKIDGEGRCIITDHEHFVLFNIYGPRAVADDTQRIQFKHDFYNILQKRWESLLDQGRRIFVVGDLNIAPYAIDRCDAGPDFEKNEFRTWFRSLLVENGGGFFDVFREKHPQRREAYTCWSTNSGAEEFNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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