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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002068`

染色体: Chr08 坐标: 18545630-18550657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002068`
名称	SmilChr08G002068
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18545630 - 18550657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001555`
GeneID	`131001555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001555`
原始查询	`LOC131001555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 6-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 6-like
Arabidopsis	`AT1G19860` (AT1G19860) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838574] identity=29.5; qcov=0.395; evalue=4.82e-17; confidence=low
Rice	`Os04g0663200` (OsC3H30) - identity=33.9; qcov=0.315; evalue=8.91e-17; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783996.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057783996.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057783996.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783996.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18545856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B78,C82
`Chr8:18545899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:18545916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:18546002`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A7,B120,B23,B56,B81,B87,B96,C18,C41,C44,C46,C53
`Chr8:18546187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B33
`Chr8:18546367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B82,C48,D11
`Chr8:18546439`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A19,B112,B113,B114,B124,B136,B51,B52,B56,B57,B62,B69,B80,B96,C11,C14,C15,C24,C3,C54,C62,C69,C84
`Chr8:18546486`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18546486`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18546977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C8
`Chr8:18550362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928013.1
AGGTGTGATCGCTGTCACTGAGTTCGCTTGGCTCATAACACACAACGCACCACCCCGCGCTCAATAATCCGAGTAGGGTTTCTCGATTTCGAGCAATCTGAGAATCTAGGTTTTTAAATTTTGTTTCCTTTTTTGGTTGCAATTACTTGGAGCGACGTTTCGGACAACTTTGAAATACTTGCTAAAATAGGCGGCCGGAATTGATTTTTAATACGGAACTGGGATAATTGTTTATGGAGTGGTGTTGCATGACTGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001555
ATGAAGGATTCGACGAAGAAATCCACCAGGGTTTCACCGTCGCAGGCGGCCGACCTCCGTCAAGCAAAGAGCCTGTTACCAGAGGATCAACCTGCAAGAGTTAAAACTAAATCACAGCCATCATGTTCTAATGTTGTGCGCTCGAAAAATCACCTTGCTTGGTATGTTGCACTAAACACAAAACAATTAGAAAAGAAGATCTCTCACATTCCTCAGATCAAATGGAAATGCCCTCCCAAATTTGCTTTAAATACTGGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783996.1
MKDSTKKSTRVSPSQAADLRQAKSLLPEDQPARVKTKSQPSCSNVVRSKNHLAWYVALNTKQLEKKISHIPQIKWKCPPKFALNTGWHVVSGEESQEAEAQKCTESADLTTIPPCLFTPLLVEVDCHDNSETPIIPIIPIEEMAAEMPFDTSGQPLASCPSVSGDLPVSQSDPSESEDQSVHGKSLPHILHGLESGDLEIAVAAAATVAAVMKSKDHIDTGLLIKFLSDPKMIKKLMNGNGLTSKLEDEAPPAPKAITSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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