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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002125`

染色体: Chr08 坐标: 19116663-19118745 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002125`
名称	SmilChr08G002125
描述	probable serine/threonine-protein kinase PIX13
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19116663 - 19118745 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001598`
GeneID	`131001598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001598`
原始查询	`LOC131001598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase PIX13
产物	probable serine/threonine-protein kinase PIX13
Arabidopsis	`AT4G35600` (CST) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829712] identity=61.8; qcov=0.965; evalue=6.35e-169; confidence=high
Rice	`Os06g0727400` (OsRLCK220) - identity=64.8; qcov=0.846; evalue=1.67e-166; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057784087.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057784087.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784088.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784088.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784088.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19117109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:19117235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:19117253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr8:19117771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784087.1

421 aa

210

421

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 89-392 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 91-393 aa

XP_057784088.1

396 aa

198

396

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 89-367 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 91-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784087.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	89	392	5.3e-41	141.5	Protein kinase domain
`XP_057784087.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	91	393	5.7e-43	147.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057784088.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	89	367	2e-45	156.0	Protein kinase domain
`XP_057784088.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	91	368	1.7e-47	162.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928105.1
GAAGAAATTCACCATTCCTGCATTAATCAGTGAATCATAGAAACAACATCGACATTTCCTAATTATTTAGACTAATTTCAAAAGTCCAACACTAATTCCCATCCACACCCATCTTATAGTTGCGCTCTCTCTATATATACATAAAAATCTAATCTTTTTGGTCCTCTTTATTCAAAATCTATCATTCTTGCAACCAATATTAGTCTTAATTTCCTTATTTGCTAAAGAATTACTTAGTAATTGAAGTGTTGTGGGCGTGG...

XM_057928104.1
CATTAATCAGTGAATCATAGAAACAACATCGACATTTCCTAATTATTTAGACTAATTTCAAAAGTCCAACACTAATTCCCATCCACACCCATCTTATAGTTGCGCTCTCTCTATATATACATAAAAATCTAATCTTTTTGGTCCTCTTTATTCAAAATCTATCATTCTTGCAACCAATATTAGTCTTAATTTCCTTATTTGCTAAAGAATTACTTAGTAATTGAAGTGTTGTGGGCGTGGAAGTGAATTTCTCAAATGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001598
ATGGGAAATTGCTTTCGATCTCAGCTAGCTGCGGATCCCAGCCCTATTCCTGCTATTAATAATTCCAGTGGACAATCCACTCAAGCGACTTGGCCTAATCACAGCAATGGCGGAACGAGCTCTGCGACGGACAGCAGCAGCAGAGGGCTTAGCCAGATTTCAAATGGTGCGAGTGATGAAGGTGTTGTTGGGGGAGAAATATTGGCGACTCCAAATGTAAAAGTGTATAATTTTGGTGATTTGAAGAGTGCGACGAGGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784087.1
MGNCFRSQLAADPSPIPAINNSSGQSTQATWPNHSNGGTSSATDSSSRGLSQISNGASDEGVVGGEILATPNVKVYNFGDLKSATRGFKSDMVLGVGGFGTVYKGWVDEITLLPTRHGTGMLVAIKKLNQESTQGFDEWQAEVDFLGRLSHPNLVKLLGYCLDDQELLLVYEFMPRGSLENHLFRRNAATEPLSWDIRLKIAIGAARGLAFLHSSEKQVIYRDFKASNILLDGSYSAKISDFGLAKLGPAAGNTHVTTRI...

XP_057784088.1
MGNCFRSQLAADPSPIPAINNSSGQSTQATWPNHSNGGTSSATDSSSRGLSQISNGASDEGVVGGEILATPNVKVYNFGDLKSATRGFKSDMVLGVGGFGTVYKGWVDEITLLPTRHGTGMLVAIKKLNQESTQGFDEWQAEVDFLGRLSHPNLVKLLGYCLDDQELLLVYEFMPRGSLENHLFRRNAATEPLSWDIRLKIAIGAARGLAFLHSSEKQVIYRDFKASNILLDGSYSAKISDFGLAKLGPAAGNTHVTTRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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