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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002147`

染色体: Chr08 坐标: 19332232-19336673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002147`
名称	SmilChr08G002147
描述	RHOMBOID-like protein 9, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19332232 - 19336673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001599`
GeneID	`131001599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001599`
原始查询	`LOC131001599`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RHOMBOID-like protein 9, chloroplastic
产物	RHOMBOID-like protein 9%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G38510` (AT5G38510) Rhomboid-related intramembrane serine protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833839] identity=42.7; qcov=0.885; evalue=1.89e-92; confidence=medium
Rice	`Os02g0326700` (OsRhmbd6) - identity=44; qcov=0.555; evalue=4.2e-48; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01694 (Rhomboid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784089.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057784089.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784089.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784089.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19333231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64
`Chr8:19333415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B42,B43
`Chr8:19333492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:19333944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:19335386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B28,B77
`Chr8:19336003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:19336030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:19336351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:19336361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:19336457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B77,C19,D10
`Chr8:19336461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B77,C19,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784089.1

418 aa

209

418

Rhomboid

PF01694 Rhomboid 226-363 aa

XP_057784090.1

418 aa

209

418

Rhomboid

PF01694 Rhomboid 226-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784089.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	226	363	2.5e-31	109.5	Rhomboid domain
`XP_057784090.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	226	363	2.5e-31	109.5	Rhomboid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928107.1
AAAAGAAAATGTTGAGATAGAGGGTGGCGATGTGGAGCTAGACGTTGACTTGGCGGACCCACAAGATCGCATTGGAAAGAAAGTAGTGGCTGTACAAGTACATCGTACACGTGGCGGAATATGGGTGGGTGAAGCGATGATAACTGATAAGGCATAATTCCTTGTTTGGACTCTTCCACGACTTGTCCCTTTTCAAGAAGAGCTCAAGTTCGAAGCCTTCCGGGCACTCGCATTTATGAAAGTACAACTTCAAGCTGGTG...

XM_057928106.1
GTCGGCGGCTACTTGTTTGTTGAAATGCCTCAACCAAAATTTGTTCATATTTCTTTTTTTTGGGTATGTTGAATATTTGCATACGATACGATTAGTTATTGTGATGTTACGCTCACAGCCCATGCAGCATGTTTTGTGTCACTGACGTCGTAGCTGTTTGTTGATTCAGATATACATGGCGTCCGTTTCGGGGAGTCATAGATTATTCTGTACAGATAATAATCTATTATGCGCAAAAGGTAAGAGGGAGCTTGTATCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001599
ATGGCGTCCGTTTCGGGGAGTCATAGATTATTCTGTACAGATAATAATCTATTATGCGCAAAAGGTAAGAGGGAGCTTGTATCATGTGATGCTTTCACTCCCGCAATAAAAAGAAACATGTTGAAAGGTGAAACTGGAACTAAAGTGGGCGAGTTCATGCTTCAAACATCTTTGCCTCCGAGAAATCAAAAGGGCTTGCTATGTCCCTCCATTACCAGGAGCCGACGTAAGGAAAAATATTGCATAATTGCAAAAGCAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784089.1
MASVSGSHRLFCTDNNLLCAKGKRELVSCDAFTPAIKRNMLKGETGTKVGEFMLQTSLPPRNQKGLLCPSITRSRRKEKYCIIAKATSSSVEHLSSLNSYLEKLRDYAKQPSSRISKERRVSIDVESEIIFNKDTRASVDTSAKKDLGIGGERSFKNYIELKLDNTESKEQSSIDAPDFYLIGVLVSINIAVFLFEIATPVKSSTFELFSLPTVYGAKINNLILHGEWWRLVTPIFLHSGIVHIALGSWALFTFGLEVSR...

XP_057784090.1
MASVSGSHRLFCTDNNLLCAKGKRELVSCDAFTPAIKRNMLKGETGTKVGEFMLQTSLPPRNQKGLLCPSITRSRRKEKYCIIAKATSSSVEHLSSLNSYLEKLRDYAKQPSSRISKERRVSIDVESEIIFNKDTRASVDTSAKKDLGIGGERSFKNYIELKLDNTESKEQSSIDAPDFYLIGVLVSINIAVFLFEIATPVKSSTFELFSLPTVYGAKINNLILHGEWWRLVTPIFLHSGIVHIALGSWALFTFGLEVSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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