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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002114`

染色体: Chr08 坐标: 19006287-19011588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002114`
名称	SmilChr08G002114
描述	probable inactive purple acid phosphatase 28
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19006287 - 19011588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001604`
GeneID	`131001604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001604`
原始查询	`LOC131001604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive purple acid phosphatase 28
产物	probable inactive purple acid phosphatase 28
Arabidopsis	`AT5G57140` (PAP28) purple acid phosphatase 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835820] identity=60.6; qcov=0.98; evalue=9.83e-179; confidence=high
Rice	`Os06g0699200` - identity=60; qcov=0.9; evalue=2.97e-153; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057784104.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057784104.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784104.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784104.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784104.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19007955`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A15,A21,A22,A24,B101,B106,B109,B117,B120,B123,B124,B135,B17,B35,B50,B51,B58,B61,B75,B99,C11,C23,C27,C31,C34,C35,C41,C51,C59,C61,C69,C72,C85,C86,D9
`Chr8:19007987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:19007992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B19,B64,C1
`Chr8:19007997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B76,C11,C69
`Chr8:19008000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B13,B16,C58
`Chr8:19010191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C8
`Chr8:19010430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C50
`Chr8:19010473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B104,B29,B33
`Chr8:19011049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:19011063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,C18,C44,C46,C53
`Chr8:19011151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:19011222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784104.1

409 aa

204

409

Metallophos

PF00149 Metallophos 58-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784104.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	58	334	5e-13	50.6	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928121.1
AAAGAAAAAAGAAGATGAAGATTAATTTCTGCTTATTGTCAAATAATTATTAGTACTGAAAACATTTGAACTTACTGAAATGACTTTGTGCCGGAAGCATACATACGAATTCTTAATTGTGGGGATTCACCTTCTTCCTAATAGTATTAGCAAAAGCGGAAAGTCAAAGAAATCTCTCGCCCTCTCAGGCTAAGAAAGAGGGTCGAGCAGGGGGGCTAGTGCGGTTGGACAACACTCTCTCTCCCGTTTTAATGGAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001604
ATGGAAGAGGGAGTGACATGGATTCACTCTATCCTGTACCTCGTACTTGTGTGCTCGGCTGTACACCTACTCGACACGCATCTTGTCTCCCCAAAACTCAGCATAAACCATCAGAATGTGCGAATTAAGAAAGCGCCATCAACCCCTCTGCGTTTTCGTTCCGACGGCACTTTCAAAATCCTCCAAGTGGCGGATATGCATTTCGGGAATGGGAAGTTGACTCCATGTAGGGATGTGTTGGAGAGTGAGTTTGTTGGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784104.1
MEEGVTWIHSILYLVLVCSAVHLLDTHLVSPKLSINHQNVRIKKAPSTPLRFRSDGTFKILQVADMHFGNGKLTPCRDVLESEFVGCSDLNTTRFLERMIQLEKPDFVAFTGDNIFGSTANDAAESLLQAFGPVMKSGIPWAAILGNHDQESTMTREELMSFLSLMDFSLSQTFPSVEDSFHPDKQVPVPNIDGFGNYDLRIWGAPGSNIANSTVLNLYFIDSGDRAVVNGVRTYDWIKESQLNWLRNVSQKLQVQEIKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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