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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002094`

染色体: Chr08 坐标: 18828906-18833222 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002094`
名称	SmilChr08G002094
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18828906 - 18833222 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001608`
GeneID	`131001608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001608`
原始查询	`LOC131001608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 homolog
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 homolog
Arabidopsis	`AT4G38630` (RPN10) regulatory particle non-ATPase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830019] identity=65; qcov=1.02; evalue=9.94e-170; confidence=high
Rice	`Os03g0243300` (OsS5a) - identity=68.6; qcov=1.01; evalue=3.24e-179; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0008540 (proteasome regulatory particle, base subcomplex); GO:0031593 (polyubiquitin modification-dependent protein binding); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00092 (VWA); PF02809 (UIM); PF13519 (VWA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784114.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784114.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784114.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784114.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18829296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:18830079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:18830380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B17,B64
`Chr8:18830646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18832516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784114.1

406 aa

203

406

VWA_2

VWA

UIM

PF13519 VWA_2 6-115 aa PF00092 VWA 8-162 aa PF02809 UIM 221-234 aa PF02809 UIM 288-304 aa PF02809 UIM 321-336 aa

XP_057784115.1

399 aa

200

399

VWA_2

VWA

UIM

PF13519 VWA_2 6-115 aa PF00092 VWA 8-162 aa PF02809 UIM 221-234 aa PF02809 UIM 288-304 aa PF02809 UIM 321-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784114.1`	Pfam	`PF13519`	VWA_2	Domain	6	115	1.3e-32	113.4	von Willebrand factor type A domain
`XP_057784114.1`	Pfam	`PF00092`	VWA	Domain	8	162	2.5e-05	25.3	von Willebrand factor type A domain
`XP_057784114.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	221	234	9.8e-07	28.9	Ubiquitin interaction motif
`XP_057784114.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	288	304	9.8e-07	28.9	Ubiquitin interaction motif
`XP_057784114.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	321	336	9.8e-07	28.9	Ubiquitin interaction motif
`XP_057784115.1`	Pfam	`PF13519`	VWA_2	Domain	6	115	1.2e-32	113.5	von Willebrand factor type A domain
`XP_057784115.1`	Pfam	`PF00092`	VWA	Domain	8	162	2.4e-05	25.3	von Willebrand factor type A domain
`XP_057784115.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	221	234	8.3e-07	29.1	Ubiquitin interaction motif
`XP_057784115.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	288	304	8.3e-07	29.1	Ubiquitin interaction motif
`XP_057784115.1`	Pfam	`PF02809`	UIM	Motif	321	336	8.3e-07	29.1	Ubiquitin interaction motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928132.1
ATTTTTTAGAATTTTCCTAGACTATAGTATAAATATACAAAGTCTACGGGCCTATTTTATTTTGTTGAAACATGAGGGGTCAAATTGCTCAAACCGGAAAATAAATACTGTAAGTCTGTAAGTAAGAAACCCTTCTCCATTTTCAAACAGGGTATTTTGTGCCCCTCTTCCAAGTAACCCAAAATTCTCCCACAAAACAATTCTACTAATTTCTCCTCATTTTTTAGCTGTATTTATCTCTCCATAGTGCGATTCCAATT...

XM_057928131.1
GTTGAAACATGAGGGGTCAAATTGCTCAAACCGGAAAATAAATACTGTAAGTCTGTAAGTAAGAAACCCTTCTCCATTTTCAAACAGGGTATTTTGTGCCCCTCTTCCAAGTAACCCAAAATTCTCCCACAAAACAATTCTACTAATTTCTCCTCATTTTTTAGCTGTATTTATCTCTCCATAGTGCGATTCCAATTCTCTGCAATCATGGTGCTCGAGGCTACGATGATCTGCATCGATAATTCGGAGTGGATGCGTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001608
ATGGTGCTCGAGGCTACGATGATCTGCATCGATAATTCGGAGTGGATGCGTAACGGCGACTACTCCCCCACTCGGTTCGACGCTCAAAAGGACGCTGTTAGCCTAATCTGTGGAGCGAAGACTCAGAACAATCCGGAGAATACTGTTGGTGTGTTGACAATGGCCGGAAAGGGGGTTCGTGTGTTGGTCACTCCGACCAGTGATCTTGGCAAGATCTTGGCCTGCGCACACGGTGTAGAAGTAGGTGGTGAGATGAACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784114.1
MVLEATMICIDNSEWMRNGDYSPTRFDAQKDAVSLICGAKTQNNPENTVGVLTMAGKGVRVLVTPTSDLGKILACAHGVEVGGEMNLAAGIQVAQLALKHRQNKKQQQRIIVFVGSPVKYDKKVLELIGRKLKKNSVALDIVNFGEEDEEKTEKLEALLAAVNNNDSSHIVHVPPGPSALSDVLISTPIFTGDGEGASGYVAAAAAAAGGGFEFGVDPNLDPELALALRVSMEEERARQEAAAKKAAEEAALGEKGEQQS...

XP_057784115.1
MVLEATMICIDNSEWMRNGDYSPTRFDAQKDAVSLICGAKTQNNPENTVGVLTMAGKGVRVLVTPTSDLGKILACAHGVEVGGEMNLAAGIQVAQLALKHRQNKKQQQRIIVFVGSPVKYDKKVLELIGRKLKKNSVALDIVNFGEEDEEKTEKLEALLAAVNNNDSSHIVHVPPGPSALSDVLISTPIFTGDGEGASGYVAAAAAAAGGGFEFGVDPNLDPELALALRVSMEEERARQEAAAKKAAEEAALGEKGEQQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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