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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004328`

染色体: Chr01 坐标: 61427614-61432136 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004328`
名称	SmilChr01G004328
描述	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61427614 - 61432136 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001612`
GeneID	`131001612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001612`
原始查询	`LOC131001612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
产物	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
Arabidopsis	`AT3G20860` (NEK5) Serine/Threonine kinase catalytic domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821634] identity=69.4; qcov=0.481; evalue=1.94e-155; confidence=medium
Rice	`Os02g0590800` (OsNek6) - identity=65.7; qcov=0.473; evalue=1.43e-141; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784125.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057784125.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784125.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784125.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61430073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:61430219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:61431115`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B86,B9,C44
`Chr1:61431115`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B86,B9,C44
`Chr1:61431275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B46
`Chr1:61431277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:61431307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:61431515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:61431711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C78
`Chr1:61431716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784125.1

611 aa

306

611

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 15-268 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-265 aa

XP_057784134.1

611 aa

306

611

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 15-268 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784125.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	15	268	9.8e-67	225.8	Protein kinase domain
`XP_057784125.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	17	265	3.5e-41	142.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057784134.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	15	268	9.8e-67	225.8	Protein kinase domain
`XP_057784134.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	17	265	3.5e-41	142.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928142.1
GTGGTGTGATCTACAGATTCTGACCCTTCGTTTAATCTCATTTGTCTAGTTTATTCAGGTAGATCAACTTTCTCCACAACCACACTATGCTTTTTCAGCTTTAATTAAGCCGCTTTTCCTCGCAATCAATTCTTTAATTCTACATTTGTGACTCTAATTTGCTGCATGAGCCGCACCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACAAACTATGGTGTAGCCTGTATCATAAC...

XM_057928151.1
AATCTCATTTGTCTAGTTTATTCAGGTAGATCAACTTTCTCCACAACCACACTATGCTTTTTCAGCTTTAATTAAGCCGCTTTTCCTCGCAATCAATTCTTTAATTCTACATTTGTGACTCTAATTTGCTGCATGAGCCGCACCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACAAACTATGGTGTAGCCTGTATCATAACTTTTTGTACAACGCCACAACTCTTTCTTTGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001612
ATGGAGAGAGAAAACGGCGTTTCGAAGTCGAAGATGGAAGATTATGAAGCCATAGAGCAGATTGGGAAGGGCGCTTTTGGAGCTGCATTTCTTGTGCGGCATAAAACTGAGAATACGAAGTATGTCCTAAAGAAAATTCGTCTCTCTAAGCAGTTGGAGAAGTTCAAGAGCAAAGCATTCCAGGAGATGGATTTAATTGCAAAACTAAGCCATCCATATATAGTTGAATACAAAGATGCTTGGCTGGAAAAGGGGAACTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784125.1
MERENGVSKSKMEDYEAIEQIGKGAFGAAFLVRHKTENTKYVLKKIRLSKQLEKFKSKAFQEMDLIAKLSHPYIVEYKDAWLEKGNCICILSNYCESGNISDVIRKARRAYFPEEKICKWMTQLLLAIDYLHSNRVLHRNLKLSNIFVTKENNIRLGDFGLAKLLNGESLASSAVGTPNYMCPELLANTPYGYKSDIWSLGCCMFEIAAHQQAFKAPDMNGLINKINRSLISPMPIIYSSTLKQIIKSMLRKSPEHRPTA...

XP_057784134.1
MERENGVSKSKMEDYEAIEQIGKGAFGAAFLVRHKTENTKYVLKKIRLSKQLEKFKSKAFQEMDLIAKLSHPYIVEYKDAWLEKGNCICILSNYCESGNISDVIRKARRAYFPEEKICKWMTQLLLAIDYLHSNRVLHRNLKLSNIFVTKENNIRLGDFGLAKLLNGESLASSAVGTPNYMCPELLANTPYGYKSDIWSLGCCMFEIAAHQQAFKAPDMNGLINKINRSLISPMPIIYSSTLKQIIKSMLRKSPEHRPTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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