当前解析结果
SmilChr08G002021| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002021 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002021 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002021 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 17987794 - 17989122 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001628 |
|---|---|
| GeneID | 131001628 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001628 |
| 原始查询 | LOC131001628 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001628 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.60000 | XP_057784150.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057784150.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057784150.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057784150.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784150.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:17988066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr8:17988396 |
A |
AT |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 76 | A10,A20,A22,A23,A25,A3,A7,A8,A9,B103,B107,B111,B113,B114,B115,B117,B120,B129,B13,B132,B133,B134,B135,B27,B30,B37,B38,B39,B4,B40,B46,B5,B50,B52,B54,B57,B6,B60,B61,B62,B63,B66,B71,B72,B78,B79,B91,B93,B99,C15,C19,C26,C29,C33,C37,C4,C41,C49,C51,C54,C57,C62,C64,C66,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C83,C85,C86,D10,D3,D8 |
Chr8:17988601 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A24,B106,B122,B134,B31,B58,B75,C16,C2,C48,C50 |
Chr8:17988700 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 34 | A4,A6,B106,B107,B118,B122,B130,B134,B136,B138,B140,B16,B35,B47,B58,B61,B66,B67,B69,B70,B77,C13,C15,C2,C20,C27,C44,C46,C49,C50,C53,C69,D10,D9 |
Chr8:17988702 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 34 | A4,A6,B106,B107,B118,B122,B130,B134,B136,B138,B140,B16,B35,B47,B58,B61,B66,B67,B69,B70,B77,C13,C15,C2,C20,C27,C44,C46,C49,C50,C53,C69,D10,D9 |
Chr8:17988736 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A4,B106,B118,B122,B136,B16,B35,B58,B61,B67,B69,B70,B77,C15,C20,C27,C46,C69,D10,D9 |
Chr8:17988742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A4,B106,B118,B122,B136,B16,B35,B58,B67,B69,B70,B77,C15,C20,C27,C46,D10,D9 |
Chr8:17988778 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A15,A24,B36,B38,B39,B41,B47,B7,B78,B88,C86,D5 |
Chr8:17988797 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B107,B16,B89 |
Chr8:17988797 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B107,B16,B89 |
Chr8:17988871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。