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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004390`

染色体: Chr01 坐标: 62056274-62058662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004390`
名称	SmilChr01G004390
描述	cytokinin dehydrogenase 9
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62056274 - 62058662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001647`
GeneID	`131001647`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001647`
原始查询	`LOC131001647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin dehydrogenase 9
产物	cytokinin dehydrogenase 9
Arabidopsis	`AT2G41510` (CKX1) cytokinin oxidase/dehydrogenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818749] identity=61.3; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0374200` (OsCKX9) - identity=62; qcov=0.892; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009690 (cytokinin metabolic process); GO:0019139 (cytokinin dehydrogenase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF09265 (Cytokin-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001647

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057784190.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057784190.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057784190.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784190.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62056446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C63,D9
`Chr1:62056744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:62056850`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr1:62056850`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31
`Chr1:62056954`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr1:62056954`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr1:62057223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:62057349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:62057424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:62057581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,C47,D11
`Chr1:62057599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,B42,C47
`Chr1:62057926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784190.1

558 aa

279

558

FAD_binding_4

Cytokin-bind

PF01565 FAD_binding_4 90-233 aa PF09265 Cytokin-bind 265-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784190.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	90	233	8.4e-19	68.4	FAD binding domain
`XP_057784190.1`	Pfam	`PF09265`	Cytokin-bind	Domain	265	541	1.4e-115	386.2	Cytokinin dehydrogenase 1, FAD and cytokinin binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928207.1
ATGCAAGAATCATGTTTGCAGCAAAATGTGAAGTCACTAAGTCCTCAAAAGTGTGAGGATAGCAGTGATTGGTCCAAGTGTACAAATATATTTGCCCCAAATAGTCTCAAGCAAAAAAGGTGATGCAATCAAATATTGAAAAAGTTTGTTGCAATATCTCCTTTATTTTGGATATAAGTATCTCCACTTAAGAAGAACTAAACATAGGACCAAGACAAATTTGAAAACGCCTTATTGCATAGTGAAAGAAAGAGAAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001647
ATGTTGCGTTCCCAGTCTCGAAAACTTGGGTACGAGATGCTTATCGGAGAGTGCCTCACTTTCTTTAGACAGAAAACCAGAGCTCTTCTTGTACTAGTTTTGTTGCACAGTTTCATGATCATTTGTTCTAACCACCCTTTTGCCACCCCACAAACCGATGAATCTCTAGTGCATTCATCCCTGGCCAAGATGAGGTTCGAGGGGAACTTGTCTTTCAATAATATGGAGTTTGCAGCAAGGGACTTCGGCAATAGATACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784190.1
MLRSQSRKLGYEMLIGECLTFFRQKTRALLVLVLLHSFMIICSNHPFATPQTDESLVHSSLAKMRFEGNLSFNNMEFAARDFGNRYHLMPSAVLHPKSVSDILSVVRYVYDLGLNSELTVAARGHGHSLEGQAQVHQGVVISMESLRVPEMSFHTGKHPYVDVSAGVLWIDILHESLKQGLTPRSWTDYLHLTVGGTLSNAGISGQAFRHGPQINNVYQLQVVTGRGEVATCSEEQNADLFHAVLGGLGQFGIITQARIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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