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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002186`

染色体: Chr08 坐标: 19733790-19734855 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002186`
名称	SmilChr08G002186
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19733790 - 19734855 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001650`
GeneID	`131001650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001650`
原始查询	`LOC131001650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.7
产物	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.7
Arabidopsis	`AT5G38210` (AT5G38210) Protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833803] identity=27.2; qcov=0.904; evalue=2.25e-22; confidence=low
Rice	`Os01g0136800` (OsWAK2) - identity=26.6; qcov=0.868; evalue=2.55e-12; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind); PF14380 (WAK_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057784189.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057784189.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784189.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784189.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19733913`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A10,A7,B135,C33
`Chr8:19733913`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A10,A7,B135,C33
`Chr8:19734029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B55,C23
`Chr8:19734061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B9,C11,C21,C69
`Chr8:19734127`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A5,B104,B105,B114,B118,B126,B128,B44,B70,B97,C1,C11,C12,C17,C21,C40,C58,C69,C73,C83
`Chr8:19734191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C53,C57
`Chr8:19734265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B76
`Chr8:19734284`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A1,A16,A2,B1,B100,B102,B109,B110,B114,B117,B119,B12,B127,B133,B134,B135,B138,B14,B140,B17,B18,B3,B35,B37,B40,B45,B49,B51,B57,B59,B88,B89,C20,C28,C39,C40,C49,C50,C52,C53,C61,C62,C73,C74,C77,C81,C82
`Chr8:19734287`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A1,A16,A2,B1,B100,B102,B109,B110,B114,B117,B119,B12,B127,B133,B134,B135,B138,B14,B140,B17,B18,B3,B35,B37,B40,B45,B49,B51,B57,B59,B88,B89,C20,C28,C39,C40,C49,C50,C52,C53,C61,C62,C73,C74,C77,C81,C82
`Chr8:19734293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C72
`Chr8:19734352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B66,B8
`Chr8:19734376`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A11,A13,A21,A5,B108,B13,B130,B133,B19,B24,B37,B4,B46,B50,B63,B85,B87,B94,B99,C10,C16,C20,C28,C38,C43,C5,C55,C57,C60,C65,C67,C74,C75,C81,C87,D3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784189.1

281 aa

140

281

GUB_WAK_bind

WAK_assoc

PF13947 GUB_WAK_bind 32-96 aa PF14380 WAK_assoc 180-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784189.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	32	96	6.4e-16	59.2	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057784189.1`	Pfam	`PF14380`	WAK_assoc	Domain	180	246	2.1e-11	45.1	Wall-associated receptor kinase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928206.1
TAAAGTCCGCCCACAGAAGCTTCCATTTATTGGAAAAATGAGTCAAAGACATTAAACAAAACCAAACTCGGCCATGATCTCGTAACCAATTCCTCCTCTGAGCCAAAGAAGAAAAATGAATCAAGGGTTTCTCCTCCCGATGCTGGTGAGCCTCGTACTCGTAGTGATGAGAATCCCGGGCAGGGTGTGCCAAGATGATTACGAAACCTGCAGGCAGCCATTTCAGTGTGGAGACCAAACAGATATCCCGTATCCATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001650
ATGAATCAAGGGTTTCTCCTCCCGATGCTGGTGAGCCTCGTACTCGTAGTGATGAGAATCCCGGGCAGGGTGTGCCAAGATGATTACGAAACCTGCAGGCAGCCATTTCAGTGTGGAGACCAAACAGATATCCCGTATCCATTCTACGGGGGAGTCCGCCCAGTTTCGTGCGGCTTTCCGGGGTTCGAGATGAGCTGCCAAGAGGGCGTTCCCCTCATTAACACCTCACAGATAATCTACCGCGTCCGTGAAATCAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784189.1
MNQGFLLPMLVSLVLVVMRIPGRVCQDDYETCRQPFQCGDQTDIPYPFYGGVRPVSCGFPGFEMSCQEGVPLINTSQIIYRVREINNQTQTLTVARNDLWNNTCSPQLFNTSVDTDLYSLYSAANDQEITLVYGCSGQTQFPQPNQFNCDATGEINGLAYFTTIALPQLPPNISITCNGPQITVRLDQTEAARLATNPSLSSLEASLQTGFSIQWLADNQNCESCLGSGGECGSNPLGSFACHCANGTFESTCSNAPNQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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