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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002085`

染色体: Chr08 坐标: 18736226-18737433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002085`
名称	SmilChr08G002085
描述	glycine-rich protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18736226 - 18737433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001663`
GeneID	`131001663`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001663`
原始查询	`LOC131001663`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich protein 2-like
产物	glycine-rich protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G36020` (CSDP1) cold shock domain protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829758] identity=42.3; qcov=1.13; evalue=2.28e-45; confidence=medium
Rice	`Os02g0121100` (OsCSP1) - identity=51.2; qcov=1.01; evalue=2.7e-39; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF00313 (CSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001663

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784208.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784208.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784208.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784208.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18736511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B24,C39
`Chr8:18736712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B100,B24,C39
`Chr8:18736719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18736853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr8:18737019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr8:18737111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:18737114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:18737115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B24,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784208.1

254 aa

127

254

CSD

zf-CCHC

PF00313 CSD 10-73 aa PF00098 zf-CCHC 121-137 aa PF00098 zf-CCHC 153-169 aa PF00098 zf-CCHC 184-198 aa PF00098 zf-CCHC 236-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784208.1`	Pfam	`PF00313`	CSD	Domain	10	73	1.5e-24	86.3	'Cold-shock' DNA-binding domain
`XP_057784208.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	121	137	4e-29	100.1	Zinc knuckle
`XP_057784208.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	153	169	4e-29	100.1	Zinc knuckle
`XP_057784208.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	184	198	4e-29	100.1	Zinc knuckle
`XP_057784208.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	236	252	4e-29	100.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928225.1
ATGTAAAAGCCCTAAAGGCGCCGAAACGCAACAATTTTATTAGGGCTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTTTTCTTTTATAAATATCACACACAATCACACACGAGACGCACAAACAAAAAACTCTCTTCCGTCTCTATATATAATCATATATATCGGGGGGTTTTTTAGGGTTTCTTTCGTCGGCGATCATCAATGGCGGAGGAAAAGGCTACTCGATCCAAGGGCGTTGTCACCAAATTCAACGATCACAAGGGCTACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001663
ATGGCGGAGGAAAAGGCTACTCGATCCAAGGGCGTTGTCACCAAATTCAACGATCACAAGGGCTACGGATTCATCCAGCCGGAGGAAGGAGGCGAAGATCTGTTCGTCCATCAAACCGCCATCAAATCTGACGGCTACCGCACCCTCCGCGAGGGCCAGGAGGTCGAGTTCACCATCATCCTAGAAGGCGAAAAGACCAAGGCTGCTGACGTCACCGCCCCCGGAGGCGGCCCCGTCGACACCACTTCTCGGAGGGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784208.1
MAEEKATRSKGVVTKFNDHKGYGFIQPEEGGEDLFVHQTAIKSDGYRTLREGQEVEFTIILEGEKTKAADVTAPGGGPVDTTSRRGNNSNSRGGGFGYGDRRNDGNGYGYRSGGGGGGGGECFNCGEFGHMARDCPNGSGGGGGGVGGGSGGGCYSCGGFGHMARECPSGNRGGGGGGGGAGGACFTCGEPGHMARDCVRGGGGGGRGGGGGGYSRGGGGGGGFGRFSGGGGGGGNCFSCGESGHFARECKSTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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