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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002168`

染色体: Chr08 坐标: 19620690-19622465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002168`
名称	SmilChr08G002168
描述	protein ABA DEFICIENT 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19620690 - 19622465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001665`
GeneID	`131001665`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001665`
原始查询	`LOC131001665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ABA DEFICIENT 4, chloroplastic-like
产物	protein ABA DEFICIENT 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G67080` (ABA4) abscisic acid (aba)-deficient 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843028] identity=61.8; qcov=0.85; evalue=7.25e-85; confidence=high
Rice	`Os01g0128300` (MHZ4) protein MAO HUZI 4, chloroplastic-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325995] identity=66.1; qcov=0.756; evalue=8.05e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14108 (ABA4-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001665

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784209.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057784209.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057784210.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057784209.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19621052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr8:19621445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B91,C7
`Chr8:19622085`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A1,A13,A14,A19,A21,A22,A3,A6,A7,A9,B100,B103,B106,B108,B121,B130,B132,B137,B139,B17,B2,B21,B28,B32,B33,B35,B4,B47,B49,B5,B55,B59,B60,B66,B67,B69,B70,B71,B73,B74,B75,B79,B8,B83,B84,B85,B88,B93,B99,C10,C15,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C27,C36,C38,C41,C43,C48,C5,C56,C59,C61,C62,C8,C81,C84,D2
`Chr8:19622146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr8:19622146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784209.1

249 aa

124

249

ABA4-like

PF14108 ABA4-like 89-191 aa

XP_057784210.1

234 aa

117

234

ABA4-like

PF14108 ABA4-like 89-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784209.1`	Pfam	`PF14108`	ABA4-like	Family	89	191	6.5e-23	82.2	ABA DEFICIENT 4-like
`XP_057784210.1`	Pfam	`PF14108`	ABA4-like	Family	89	216	4.5e-34	118.3	ABA DEFICIENT 4-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928226.1
GGACAACAGCCTTGTATCCAATAACATTGTCTCTCTGGATTTGATTGCCTTCAAAACTTTTACTACTCTCCGACCTTTTTTTCCCCAATTATTCACAGAAAACATTTGTGAATTGTGAGTGGGCATCTCCAGTTATGCATCCAGCCACATGGCGCCTTCGCCTCTCAAAATGGGAGCCTCAAACTTTTTCTCTTGTGTTCTCCCATTATATATTCGGACCCTTTTCTTCTTGCCTCAGCAAATGAAGCGAGATTCCCTTC...

XM_057928227.1
ACAACAGCCTTGTATCCAATAACATTGTCTCTCTGGATTTGATTGCCTTCAAAACTTTTACTACTCTCCGACCTTTTTTTCCCCAATTATTCACAGAAAACATTTGTGAATTGTGAGTGGGCATCTCCAGTTATGCATCCAGCCACATGGCGCCTTCGCCTCTCAAAATGGGAGCCTCAAACTTTTTCTCTTGTGTTCTCCCATTATATATTCGGACCCTTTTCTTCTTGCCTCAGCAAATGAAGCGAGATTCCCTTCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001665
ATGGCATTGTCTTCTTGTTTTCTCCGCACTCCACTCTGCGTTTCTCCTCTCCGGATTGATATTCACACAAGATCGCCCTCTACCAACTCATGTAGCACCCGAATGAGCCAAAGATGCAAGCTTTCTCTCGGAAGCTCGAAAATGGGTCTGAACCAATGTTGGAGGTTGAATTTTGTTGGGGGCTCAAGACCAAATCCTGGAAAAAGCAGAAACGGCTCTGTCGTATGTGCTTCGTGGCTTGCAAATTCTCAGATTGCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784209.1
MALSSCFLRTPLCVSPLRIDIHTRSPSTNSCSTRMSQRCKLSLGSSKMGLNQCWRLNFVGGSRPNPGKSRNGSVVCASWLANSQIAASAFTWGTVAVLPCYTFMVAAPQAEFTKKIVGSSIPYIVLGMLYAYLLYLSWTPDTIRFMFASKYWLPELPGIAKMFSSEMTLASAWIHLLAVDLFAARSLSLSKTQPQPQTQTQTLIPQSIYIETGRFILTDCKTMWKPGIRSLCACCFVPSEFLHISSPKQ

XP_057784210.1
MALSSCFLRTPLCVSPLRIDIHTRSPSTNSCSTRMSQRCKLSLGSSKMGLNQCWRLNFVGGSRPNPGKSRNGSVVCASWLANSQIAASAFTWGTVAVLPCYTFMVAAPQAEFTKKIVGSSIPYIVLGMLYAYLLYLSWTPDTIRFMFASKYWLPELPGIAKMFSSEMTLASAWIHLLAVDLFAARQVYFDGLQDNVETRHSVSLCLLFCPIGILTHFITKAVSGGSEKTEHGIR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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