当前解析结果
SmilChr08G002081| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002081 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002081 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002081 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 18704455 - 18708320 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001673 |
|---|---|
| GeneID | 131001673 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001673 |
| 原始查询 | LOC131001673 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | voltage-dependent L-type calcium channel subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831517]; symbol=AT5G16550; hit=AT5G16550; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | voltage-dependent L-type calcium channel subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831517]; symbol=AT5G16550; hit=AT5G16550; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G16550 (AT5G16550)voltage-dependent L-type calcium channel subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831517] identity=51.7; qcov=0.885; evalue=2.14e-66; confidence=high |
| Rice | Os08g0425800- identity=54.4; qcov=0.203; evalue=7.09e-10; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001673 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057784222.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057784222.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784222.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784222.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784222.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:18704793 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B7,B80,C48 |
Chr8:18704902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B24,C39 |
Chr8:18706698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr8:18707951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B24,C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。