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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002026`

染色体: Chr08 坐标: 18075539-18079658 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002026`
名称	SmilChr08G002026
描述	uncharacterized SmilChr08G002026
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18075539 - 18079658 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001690`
GeneID	`131001690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001690`
原始查询	`LOC131001690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carbon-sulfur lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831557]; symbol=AT5G16940; hit=AT5G16940; species=arabidopsis; confidence=high
产物	carbon-sulfur lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831557]; symbol=AT5G16940; hit=AT5G16940; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G16940` (AT5G16940) carbon-sulfur lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831557] identity=68.7; qcov=0.899; evalue=2.7e-72; confidence=high
Rice	`Os09g0397700` - identity=73.2; qcov=0.852; evalue=1.9e-70; confidence=high
GO	GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04828 (GFA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784249.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057784249.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784249.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784249.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18077184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C58,C60,C68
`Chr8:18077206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:18077297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B33
`Chr8:18077319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C32,C58,C60,C68,C8
`Chr8:18077331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B100,B122,B28
`Chr8:18077338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:18077431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B7,C33
`Chr8:18077452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18079377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18079389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18079391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:18079395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784249.1

149 aa

149

GFA

PF04828 GFA 8-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784249.1`	Pfam	`PF04828`	GFA	Domain	8	104	4.1e-11	43.7	Glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928266.1
GTCGCATTCATAATATGGAGAAGAAGGAAGGATATTGATTAAGATTCCATAAATTGGTTCATTAAACTCGTGACCGTTCCACAGCAGCCTTTGCCTTTACTCTCTCACACCACATTTGACTCGCTTTCGCTTTCAGATTAATTCGCTTCGTTACAAGATACATCTTCAATGGACTCTGAGATTGTCATGCACAGTGGTGGATGTCATTGCAAAAGAGTAAGGTGGAAAGCTGAAGCTCCTTCAAGTGTTGTAGTCTGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001690
ATGGACTCTGAGATTGTCATGCACAGTGGTGGATGTCATTGCAAAAGAGTAAGGTGGAAAGCTGAAGCTCCTTCAAGTGTTGTAGTCTGGCAATGCAACTGTTCCGATTGCTCGATGAGAGGAAACCCTCACTTCGTTGTCCCATCTCAAAAATTCGAGCTCAACGAAGATTCCAAACAGTTCCTAACAACATACACATTTGGCACACACACAGCGAAGCACATATTCTGCAAAGTTTGTGGAATTACATCATTCTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784249.1
MDSEIVMHSGGCHCKRVRWKAEAPSSVVVWQCNCSDCSMRGNPHFVVPSQKFELNEDSKQFLTTYTFGTHTAKHIFCKVCGITSFYIPRSNPDGVAVSYKCIDPGTLKHVETRHFDGQNWENSFNKSGISSFSKVLPKGSCFSSPTSTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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