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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002065`

染色体: Chr08 坐标: 18532748-18537167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002065`
名称	SmilChr08G002065
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18532748 - 18537167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001703`
GeneID	`131001703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001703`
原始查询	`LOC131001703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1
Arabidopsis	`AT2G18040` (PIN1AT) peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816316] identity=74.8; qcov=1; evalue=9.79e-63; confidence=high
Rice	`Os04g0118500` - identity=72; qcov=0.992; evalue=1.62e-50; confidence=medium
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00639 (Rotamase); PF13616 (Rotamase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784267.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057784267.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784267.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784267.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784267.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18533127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B113,B25,C16,C40
`Chr8:18533261`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B102,B11,B97,C26,C30,D1
`Chr8:18533331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784267.1

119 aa

119

Rotamase_3

Rotamase

PF13616 Rotamase_3 3-115 aa PF00639 Rotamase 11-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784267.1`	Pfam	`PF13616`	Rotamase_3	Domain	3	115	5.7e-21	75.9	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057784267.1`	Pfam	`PF00639`	Rotamase	Domain	11	116	1e-22	81.6	PPIC-type PPIASE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928284.1
TCGTGTAAGGGCTATCGTGTAACCATTGTGAGTGCTATGAGACACAAAGATTATATTGAAAACTAAGACATTCCATATTTCCATATGAAGTTGGTTTTTGGCACAAAGAAATAGTAAAAGAAAGAGATTACAGCAGCTATTTTGACCATATGTTGTTGGCCGGATAAATATATACTCCATTTTCCAACCGCCAGATCGTAAGAAGCGCACACCAACACACCGTAGAGAAAAACTCCCAATCCGCCAAAATAGAGTCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001703
ATGTCCTCTTCGGAGAAAGTCAAGGCTTCGCACATTCTCATCAAGCACCAGGGCTCCCGCCGCAAGTCCTCCTGGAAGGACCCCGACGGCACCCTCATCTCCGCCACTACCCGCGACGACGCCGTCTCCCAGCTCCAGGACCTCCGCCGCGACATCCTCGCCGGCGTCGCCTCCTTCCAGGAACTCGCCACCAAGCACTCTCACTGCAGCTCAGCCAAGCGCGGCGGCGATCTCGGTTCATTTGGAAGGGGTCAGATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784267.1
MSSSEKVKASHILIKHQGSRRKSSWKDPDGTLISATTRDDAVSQLQDLRRDILAGVASFQELATKHSHCSSAKRGGDLGSFGRGQMQKPFEEATFGLKVGEISDIVDTDSGVHIIIRTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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