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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002208`

染色体: Chr08 坐标: 20000185-20001546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002208`
名称	SmilChr08G002208
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20000185 - 20001546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001741`
GeneID	`131001741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001741`
原始查询	`LOC131001741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G15125` (AT1G15125) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838076] identity=44.1; qcov=1.01; evalue=2.05e-91; confidence=medium
Rice	`Os02g0719600` (JMT-2) - identity=31.9; qcov=1.09; evalue=1.39e-49; confidence=low
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784288.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057784288.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784288.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784288.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20000514`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B64
`Chr8:20000514`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B64
`Chr8:20000548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:20000769`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B14,C83
`Chr8:20000769`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B14,C83
`Chr8:20000943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B35,C65
`Chr8:20000946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:20001152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784288.1

344 aa

172

344

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 10-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784288.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	10	341	5.2e-96	322.5	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928305.1
ATAAATAAATAAAAATAGAAAATTGAGTTAGTATAAAGATGGAAGTGAGCGACTATATGAGCAGAAACAGCAGGGGATGGGTGAAGTCGGCGCTTCTTCTTCCAAACACCATATGATAGGAGGCGATGGCCCCAACAGTTACGCTCGCAATTCTGCATACCAGAAGGAATTGCTGGTTTCTGCAGAGGATTTGGTGCGGGAGCTCATCAGTAAGCACGTGGACACTGATTTGGAGACGTTCCGCATCGCGGACTTGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001741
ATGGGTGAAGTCGGCGCTTCTTCTTCCAAACACCATATGATAGGAGGCGATGGCCCCAACAGTTACGCTCGCAATTCTGCATACCAGAAGGAATTGCTGGTTTCTGCAGAGGATTTGGTGCGGGAGCTCATCAGTAAGCACGTGGACACTGATTTGGAGACGTTCCGCATCGCGGACTTGGGTTGTTCCGTGGGCCCCAACGCCTTCTTGGCCGTGGACAACATCATCGCTGCCGTGGAGGAGCGATGCGGAGCTCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784288.1
MGEVGASSSKHHMIGGDGPNSYARNSAYQKELLVSAEDLVRELISKHVDTDLETFRIADLGCSVGPNAFLAVDNIIAAVEERCGAHVPEFQVFFNDLIGNDFNTLFKLLPPSRNYLAAAAPGSFHGRLFPRGSIHLAHCSTALHWLSAAPEKPNKGRIHYSGAGKDVRDAYRAQYERDMDAFLSARGLELVPGGLVLLLLIGFPDGYLLASDSSIGHAFHTLGSCLYEMAKMGKIGEEEVDSFNLPFYYPSRTEVEAVIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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