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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002211`

染色体: Chr08 坐标: 20079329-20079822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002211`
名称	SmilChr08G002211
描述	polcalcin Ole e 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20079329 - 20079822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001744`
GeneID	`131001744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001744`
原始查询	`LOC131001744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polcalcin Ole e 3-like
产物	polcalcin Ole e 3-like
Arabidopsis	`AT3G03430` (AT3G03430) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718660] identity=69.1; qcov=0.964; evalue=1.34e-36; confidence=medium
Rice	`Os08g0560700` - identity=65.8; qcov=0.905; evalue=8.28e-32; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784292.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784292.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784292.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784292.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784292.1

84 aa

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF00036 EF-hand_1 12-38 aa PF13405 EF-hand_6 13-39 aa PF13499 EF-hand_7 13-70 aa PF13202 EF-hand_5 14-32 aa PF13833 EF-hand_8 14-35 aa PF13833 EF-hand_8 36-71 aa PF00036 EF-hand_1 45-71 aa PF13202 EF-hand_5 51-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	12	38	8.2e-19	66.4	EF hand domain
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	13	39	7.5e-16	57.0	EF-hand domain
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	13	70	8.6e-16	58.8	EF-hand domain pair
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	14	32	1.4e-13	50.3	EF hand
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	14	35	1.8e-10	41.1	EF-hand domain pair
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	36	71	1.8e-10	41.1	EF-hand domain pair
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	45	71	8.2e-19	66.4	EF hand domain
`XP_057784292.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	51	69	1.4e-13	50.3	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928309.1
AACCCAATGCTTTCACATTCGTATCCAAATTCCCCAAGTGAGAAAAATTTAGCAAAAAACAAGATATGGCCGATGATCCACAGGACGTAGCCGACCGGGAGCGGCTCTTCAAGCATTTCGATGCCAACGGCGACGGCCAGATCTCGGCCAACGAGCTCGGCGACGCCCTCAAGACGCTCGGCTGCGTCACCCCCGATGAAGTCAAGAACATGATGGCTGAGATCGACTCCGATGGCGATGGCTTCATATCCTACGAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001744
ATGGCCGATGATCCACAGGACGTAGCCGACCGGGAGCGGCTCTTCAAGCATTTCGATGCCAACGGCGACGGCCAGATCTCGGCCAACGAGCTCGGCGACGCCCTCAAGACGCTCGGCTGCGTCACCCCCGATGAAGTCAAGAACATGATGGCTGAGATCGACTCCGATGGCGATGGCTTCATATCCTACGAAGAGTTCACCAATTTCGCTCGTGCAAATAGGGGACTAGTCAAGGATGTTGCCAAGATATTCTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784292.1
MADDPQDVADRERLFKHFDANGDGQISANELGDALKTLGCVTPDEVKNMMAEIDSDGDGFISYEEFTNFARANRGLVKDVAKIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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